结球甘蓝自花和异花授粉诱导的柱头转录组分析 |
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引用本文: | 蒲敏,廉小平,罗绍兰,张贺翠,王玉奎,白晓璟,曾静,高启国,任雪松,朱利泉.结球甘蓝自花和异花授粉诱导的柱头转录组分析[J].园艺学报,2018,45(1):71-84. |
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作者姓名: | 蒲敏 廉小平 罗绍兰 张贺翠 王玉奎 白晓璟 曾静 高启国 任雪松 朱利泉 |
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作者单位: | 1西南大学农学与生物科技学院,重庆 400700;2重庆市蔬菜重点实验室,重庆 400700 |
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摘 要: | 分别以自花授粉30 min、异花授粉30 min和未授粉处理的甘蓝柱头进行Illumina HiSeq2000高通量转录组测序,分析自交不亲和性甘蓝自花授粉、异花授粉柱头与未授粉柱头中基因表达的差异。转录组测序共获得1.6×10~8对原始序列读取片段,总碱基数为2.38×10~(10) bp,与未授粉对照相比,自花、异花授粉后差异表达的基因分别有2 900个和2 328个,共有的差异表达基因1 904个。在差异表达基因背景和全部基因背景下,自花授粉较大比例的差异基因是细胞杀伤、胞外基质部分和核酸结合转录因子活性;异花授粉较大比例的差异基因是信号传递、胞外区域部分、结构分子活性和营养库活性。GO功能的显著性富集分析表明,自花授粉处理后特有的40个极显著的富集条目主要涉及糖跨膜转运活性、微管结合和钙调素依赖性蛋白激酶活性等。异花授粉特有的53个极显著的富集条目主要涉及法尼酸O–甲基转移酶的活性、微管负向运动和生长素跨膜运输等。自花授粉处理后特异差异表达的996个基因主要涉及钙离子结合、细胞骨架相关、茉莉酸和水杨酸代谢等生物过程,异花授粉处理后特异差异表达的424个基因主要涉及物质跨膜转运及脂质代谢。
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关 键 词: | 结球甘蓝 自交不亲和性 转录组 差异表达基因 |
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