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菜薹蛋白精氨酸甲基转移酶基因BrcuPRMT5的克隆及表达分析
引用本文:肖旭峰,张祎,吴智明,杨寅桂.菜薹蛋白精氨酸甲基转移酶基因BrcuPRMT5的克隆及表达分析[J].园艺学报,2017,44(6):1181-1188.
作者姓名:肖旭峰  张祎  吴智明  杨寅桂
作者单位:(1江西农业大学农学院,南昌 330045;2仲恺农业工程学院,广州 510225)
基金项目:国家自然科学基金项目(31360484),教育部高等学校博士学科点专项科研基金项目(20133603120006),江西省自然科学基金项目(2013BAB204009),江西农业大学博士启动基金项目(3181)
摘    要:以‘油青49’和‘油青甜菜薹80’菜薹茎尖为材料,采用RT-PCR和RACE技术克隆获得组蛋白甲基转移酶基因Brcu PRMT5的全长cDNA和gDNA序列。BrcuPRMT5 cDNA序列全长为2 117 bp,其中完整开放阅读框为1 929 bp,编码642个氨基酸,相对分子量为71.55 kD,理论等电点(p I)为5.87;多序列比对结果表明,Brcu PRMT5编码的氨基酸序列含有高等植物PRMT5基因1个高度保守的结构域;系统发育分析结果显示与大白菜、油菜及甘蓝的亲缘关系最近;亚细胞定位软件分析得知,Brcu PRMT5蛋白无跨膜区域,可能定位于线粒体中;对应的gDNA全长为4 151 bp,含有23个外显子和22个内含子,最长的外显子长度为140 bp,内含子的长度范围为50~150 bp。利用半定量RT-PCR和实时荧光定量PCR技术分析基因的表达,BrcuPRMT5在菜薹不同组织中均有表达,其中在花中表达量最高,叶次之,根中最低;BrcuPRMT5从苗期至完全抽薹开花期的表达量呈现上升趋势。BrcuPRMT5在菜薹花发育过程中可能起一定的调控作用。

关 键 词:菜薹  蛋白甲基转移酶  克隆  序列分析  时空表达

Cloning,Sequence Analysis and Expression Profile of Protein Arginine N-methyltransferase Gene BrcuPRMT5 in Flowering Chinese Cabbage
XIAO Xufeng,ZHANG Yi,WU Zhiming,YANG Yingui.Cloning,Sequence Analysis and Expression Profile of Protein Arginine N-methyltransferase Gene BrcuPRMT5 in Flowering Chinese Cabbage[J].Acta Horticulturae Sinica,2017,44(6):1181-1188.
Authors:XIAO Xufeng  ZHANG Yi  WU Zhiming  YANG Yingui
Institution:(1College of Agronomy,Jiangxi Agricultural University,Nanchang 330045,China;2College of Horticulture and Landscape Architecture,Zhongkai University of Agriculture and Engineering,Guangzhou 510225,China)
Abstract:
Keywords:flowering Chinese cabbage  protein arginine N-methyltransferase  clone  sequence analysis  expression
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