菜薹KASP-SNP指纹图谱构建及品种鉴定 |
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引用本文: | 任海龙,许东林,张晶,邹集文,李光光,周贤玉,肖婉钰,孙艺嘉.菜薹KASP-SNP指纹图谱构建及品种鉴定[J].园艺学报,2023(2):307-318. |
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作者姓名: | 任海龙 许东林 张晶 邹集文 李光光 周贤玉 肖婉钰 孙艺嘉 |
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作者单位: | 广州市农业科学研究院 |
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摘 要: | 利用前人已开发的200个芸薹种KASP-SNP分子标记对89份菜薹品种进行基因分型,共有131个标记分型成功,转化率为65.50%,缺失率为0.06,次要等位基因频率(MAF)为0.21,观测杂合度为0.21,多态性信息含量(PIC)为0.27,并将这些标记用于系统进化树构建及群体结构分析。进一步基于次要等位基因频率大于0.25,多态性信息含量大于0.35,缺失率小于0.03,杂合率小于0.6等参数,筛选出18个核心KASP-SNP分子标记,并构建了89份菜薹品种的SNP指纹图谱,证明了KASP技术在菜薹品种鉴定中的可行性。
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关 键 词: | 菜薹 KASP 指纹图谱 品种鉴定 |
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