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核桃Y2SK2型脱水素基因JrDHN的克隆、表达和单核苷酸多态性分析
引用本文:徐,丽,陈,新,魏海蓉,张力思,宗晓娟 王甲威,朱东姿,刘庆忠.核桃Y2SK2型脱水素基因JrDHN的克隆、表达和单核苷酸多态性分析[J].园艺学报,2014,41(8):1573-1582.
作者姓名:        魏海蓉  张力思  宗晓娟 王甲威  朱东姿  刘庆忠
作者单位:(山东省果树研究所,山东省果树生物技术重点实验室,山东泰安 271000)
摘    要: 采用RT-PCR和RACE技术从‘香玲’核桃(Juglans regia L.‘Xiangling’)叶片中克隆了1个脱水素基因JrDHN(GenBank 登录号KC503061.1),其全长1 056 bp,具有528 bp的开放阅读框,编码175个氨基酸组成的多肽,具有LEA家族成员的特征多肽序列,属于典型的Y2SK2型脱水素。以核桃18S基因为内参,对‘香玲’核桃JrDHN在4 ℃胁迫下的表达模式进行了初步的研究,结果表明低温诱导下叶片中JrDHN的表达增加,4 ℃处理4 h后达到最大值;自然越冬条件下,花芽中JrDHN表达量呈先上升后下降的趋势,在12月份表达量最高,推测JrDHN在核桃对低温胁迫响应中发挥重要功能。‘香玲’JrDHN在雌花中表达量高,其次是叶片和树皮,在花芽中最低。单核苷酸多态性分析JrDHN序列中有30个SNPs位点和11个Indels;单倍型分析显示12份核桃材料可分为10个单倍型,单倍型多样性为0.9697。

关 键 词:核桃  脱水素基因  定量RT-PCR  单核苷酸多态性
收稿时间:2014-05-23

Molecular Cloning,Expression and Single Nucleotide Polymorphisms Analysis of Typical Y2SK2 Dehydrin in Juglans
XU Li,CHEN Xin,WEI Hai-rong,ZHANG Li-si,ZONG Xiao-juan,WANG Jia-wei,ZHU Dong-zi,LIU Qing-zhong.Molecular Cloning,Expression and Single Nucleotide Polymorphisms Analysis of Typical Y2SK2 Dehydrin in Juglans[J].Acta Horticulturae Sinica,2014,41(8):1573-1582.
Authors:XU Li  CHEN Xin  WEI Hai-rong  ZHANG Li-si  ZONG Xiao-juan  WANG Jia-wei  ZHU Dong-zi  LIU Qing-zhong
Institution:(Shandong Province Key Laboratory of Fruit Tree Biotechnology,Shandong Institute of Pomology,Tai’an,Shandong 271000,China)
Abstract:
Keywords:Juglans Juglans  dehydrin gene  qRT-PCR  single nucleotide polymorphism
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