基于叶绿体DNA信息的南方梨属种质的遗传多样性和演化分析

选取5个叶绿体DNA非编码区trnL-trnF-1、trnL-trnF-2、trnS-psbC、accD-psaI、rps16-trnQ和1个基因区域rbcL，对中国秦岭淮河以南地区的梨（Pyrus L.）资源进行遗传多样性和演化分析。将188份梨资源的测序结果整合得到长度为5 612 bp（包含缺失片段），共检测出13个单倍型、4个单一突变位点、16个简约性信息位点和14个插入/缺失片段（InDels），单倍型多样性Hd为0.7178，核苷酸多样性为0.35 × 10-3。accD-psaI区域的分析结果显示该区域的Hd值最高，为0.7177；rbcL区域的Hd值最低，为0.0317。其中162份梨资源检测出12个单倍型，Hd为0.713，核苷酸多样性为0.29 × 10-3；梨的不同地理群体中湖南省的10个梨地方品种的Hd最高，为0.889；来自贵州省的8个品种的Hd最低，为0。138份砂梨地方品种共检测出8个叶绿体单倍型，其中单倍型H2、H4和H5在130份砂梨和37份白梨品种中检测到，单倍型H6、H10、H11、H12和H13在8份砂梨地方品种‘青皮钟’、‘甜宵梨’、‘细花红梨’、‘惠阳红梨’、‘麝香梨’、‘塘湖青’、‘红粉’和‘横县浸泡梨’中检测到。Median-joining Network图显示单倍型H6和H11为古老单倍型，H1、H4和H5为较进化的单倍型。根据叶绿体DNA序列变异信息可推测秦岭淮河以南地区的砂梨和白梨亲缘关系较近，同时来自湖南地区的砂梨种质资源具有丰富的遗传多样性。