| 牡丹5个管家基因的克隆及其在系统进化分析中的应用 |
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| 引用本文： | 杨勇,王顺利,薛璟祺,任秀霞,李丹丹,杨若雯,曾秀丽,张秀新.牡丹5个管家基因的克隆及其在系统进化分析中的应用[J].园艺学报,2016,43(2):307-313. |
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| 作者姓名： | 杨勇 王顺利 薛璟祺 任秀霞 李丹丹 杨若雯 曾秀丽 张秀新 |
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| 作者单位： | 1中国农业科学院蔬菜花卉研究所，农业部园艺作物生物学与种质创制重点实验室，北京 100081；2四川农业大学玉米研究所，农业部西南玉米生物学与遗传育种重点实验室，成都 611130；3西藏自治区农牧科学院蔬菜研究所，拉萨 850030 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金项目(31501800;31572156)，国家公益性行业(农业)科研专项(201203071)，中国农业科学院科技创新工程项目(CAAS-ASTIP-IVFCAAS)，国家‘863’计划项目(2011AA10020703) |
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| 摘 要： | 利用RT-PCR技术从牡丹组7个野生种和1个栽培种中分别克隆得到泛素延伸蛋白基因(ubiquitin,UBI)、素环蛋白基因(cyclophilin,CYP)、肌动蛋白基因(Actin)、葡萄糖六磷酸脱氢酶基因(glucose-6-phosphate 1-dehydrogenase,G6PD)和β–微管蛋白基因(beta-tubulin,TUB)等5个管家基因的编码序列(coding sequence,CDS)。序列比对分析发现,5个管家基因序列均相对保守,其在牡丹7个野生种和1个栽培种中的保守性在99.04%~99.69%。利用5个管家基因分别构建了其在牡丹组8份材料中的系统进化树。5个系统进化树均将8份材料分成两组,即革质花盘亚组和肉质花盘亚组;由于5个管家基因核苷酸序列各自的保守性不同,在区分亚组成员间略有差异。综合分析5个管家基因构建的系统进化树可知,杨山牡丹(Paeonia ostii)和栽培牡丹(P.suffruticosa‘Luoyanghong’)常聚为一支,二者亲缘关系较近,因而推测杨山牡丹可能参与了栽培牡丹的形成;紫斑牡丹(P.rockii)和四川牡丹(P.decomposita)一直聚为一支,推测二者亲缘关系较近;黄牡丹(P.lutea)和紫牡丹(P.delavayi)一直聚为一支,推测这二者亲缘关系较近。狭叶牡丹(P.potaninii)与黄牡丹和紫牡丹分化较早,结合前人研究结果建议将狭叶牡丹作为一个独立的种。
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| 关 键 词： | 牡丹 管家基因 系统发生 进化 |
Cloning of Five House-keeping Genes and Their Application in Phylogenetic Analysis of Tree Peony |
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| YANG Yong,WANG Shun-li,XUE Jing-qi,REN Xiu-xia,LI Dan-dan,YANG Ruo-wen,ZENG Xiu-li,ZHANG Xiu-xin,.Cloning of Five House-keeping Genes and Their Application in Phylogenetic Analysis of Tree Peony[J].Acta Horticulturae Sinica,2016,43(2):307-313. |
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| Authors: | YANG Yong WANG Shun-li XUE Jing-qi REN Xiu-xia LI Dan-dan YANG Ruo-wen ZENG Xiu-li ZHANG Xiu-xin |
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| Institution: | 1. School of Medicine, Jinan University, Guangzhou 510632, China;
2. The First Affiliated Hospital, Jinan University, Guangzhou 510632, China;
3. Guangdong Provincial Hospital of TCM, Guangzhou 510006, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | tree peony house-keeping gene phylogeny evolution |
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