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果实软化相关PG基因的进化分析和基因组定位
引用本文:魏潇,刘威生,刘宁,章秋平,张玉萍,刘硕,刘有春.果实软化相关PG基因的进化分析和基因组定位[J].园艺学报,2011,38(9):1791-1799.
作者姓名:魏潇  刘威生  刘宁  章秋平  张玉萍  刘硕  刘有春
作者单位:辽宁省果树科学研究所 国家果树种质熊岳李杏圃,辽宁熊岳,115009
基金项目:国家自然科学基金项目(31071767); 公益性行业(农业)科研专项(201003058)
摘    要: 利用NCBI数据库和蔷薇科基因组数据库中的数据对48个果实PG基因进行系统进化分析,结果表明3个进化支中都包含与果实软化相关的PG基因,属于A支和属于B支的PG基因有明显的功能差异。氨基酸序列分析显示,3个进化支中的PG基因存在多个差异位点,A支和C支PG基因的N端比B支短60 ~ 70个氨基酸。PG基因结构(包括启动子、内含子和编码区)的变异对其功能差异有重要影响。对苹果和桃的PG基因进行了基因组精确定位,其附近存在果实软化相关性状标记。

关 键 词:多聚半乳糖醛酸酶基因  果实软化  系统进化分析  基因组定位
收稿时间:2011-6-14
修稿时间:2011-8-16

Phylogenetic Analysis and Genomic Localization of Polygalacturonase Genes Related to Fruit Softening
WEI Xiao,LIU Wei-sheng,LIU Ning,ZHANG Qiu-ping,ZHANG Yu-ping,LIU Shuo, LIU You-chun.Phylogenetic Analysis and Genomic Localization of Polygalacturonase Genes Related to Fruit Softening[J].Acta Horticulturae Sinica,2011,38(9):1791-1799.
Authors:WEI Xiao  LIU Wei-sheng  LIU Ning  ZHANG Qiu-ping  ZHANG Yu-ping  LIU Shuo  LIU You-chun
Institution:WEI Xiao,LIU Wei-sheng*,LIU Ning,ZHANG Qiu-ping,ZHANG Yu-ping,LIU Shuo,and LIU You-chun(Liaoning Institute of Pomology,National Germplasm Repository for Plums and Apricots,Xiongyue,Liaoning 115009,China)
Abstract:Forty-eight PG genes were classified into three major clades by phylogenetic analysis and each clade contained PG genes that involved in fruit softening.PG genes belonged to clade A and clade B had functional divergence obviously.There were some different amino acid sites in amino acid sequence of PG genes from different clades.PG genes in clade A and clade C had a deletion of 60-70 amino acids in N terminal end compared with PG genes in clade B.Variation in the structure of PG genes(mainly including promot...
Keywords:polygalacturonase genes  fruit softening  phylogenetic analysis  genomic localization  
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