| 河北保定地区苹果锈果类病毒分离物的序列分析 |
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| 引用本文： | 杨金凤,郭永斌,胡同乐,王树桐,王亚南,曹克强.河北保定地区苹果锈果类病毒分离物的序列分析[J].北方园艺,2016(6):103-106. |
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| 作者姓名： | 杨金凤 郭永斌 胡同乐 王树桐 王亚南 曹克强 |
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| 作者单位： | 河北农业大学植物保护学院,河北保定,071001;河北农业大学植物保护学院,河北保定,071001;河北农业大学植物保护学院,河北保定,071001;河北农业大学植物保护学院,河北保定,071001;河北农业大学植物保护学院,河北保定,071001;河北农业大学植物保护学院,河北保定,071001 |
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| 基金项目： | 国家苹果现代产业技术体系资助项目(CARS-28)，河北省高等学校科学技术研究资助项目(YQ2014023)，河北省青年拔尖人才计划资助项目. |
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| 摘 要： | 以采自河北保定的苹果锈果类病毒(apple skin scar viroid,ASSVd)样本为试材,采用用RT-PCR方法对样本中的ASSVd全基因组序列进行扩增,然后利用生物学软件MEGA 6.0对该分离物与已发表的其它分离物序列构建系统发育树,对系统进化关系进行分析。结果表明:ASSVd保定分离物基因组全长332nt,将序列提交到GenBank,登录号为KR264032。该分离物与已发表的其它13个来自不同寄主、不同国家的ASSVd分离物间进化关系极近,核苷酸相似性为92%~99%。与加拿大苹果上的X71599株系亲缘关系最近,相似性为99%,仅在第221位有一个碱基差异,与新疆梨上的JX861259株系亲缘关系最远。系统发育分析表明,不同地区的ASSVd分离物聚类没有规律性,说明ASSVd不存在地区专化性。新疆梨、桃、杏、苹果不在同一分支,说明ASSVd可能存在一定的寄主特异性。二级结构预测表明,该分离物的中央保守区与末端保守区与ASSVd其它序列相同。
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| 关 键 词： | 苹果锈果类病毒 保定 序列分析 二级结构 |
Sequence Analysis of Apple Scar Skin Viroid Isolated From Baoding in Hebei |
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| YANG Jinfeng,GUO Yongbin,HU Tongle,WANG Shutong,WANG Yanan,CAO Keqiang.Sequence Analysis of Apple Scar Skin Viroid Isolated From Baoding in Hebei[J].Northern Horticulture,2016(6):103-106. |
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| Authors: | YANG Jinfeng GUO Yongbin HU Tongle WANG Shutong WANG Yanan CAO Keqiang |
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