| 枣类甜蛋白基因家族的鉴定与生物信息学分析 |
| |
| 引用本文： | 刘潮,韩利红,王海波,高永,唐利洲.枣类甜蛋白基因家族的鉴定与生物信息学分析[J].果树学报,2018(4). |
| |
| 作者姓名： | 刘潮 韩利红 王海波 高永 唐利洲 |
| |
| 作者单位： | 曲靖师范学院云南高原生物资源保护与利用研究中心·生物资源与食品工程学院·云南省高校云贵高原动植物多样性及生态适应性进化重点实验室 |
| |
| 摘 要： | 【目的】从枣全基因组中鉴定类甜蛋白(thaumatin like protein,TLP)基因,为枣TLP基因的功能研究与利用提供参考。【方法】通过生物信息学方法从枣基因组数据库中鉴定TLP基因家族成员,并对基因结构、进化、启动子区顺式作用元件和密码子使用性等进行分析。【结果】共鉴定到34个枣TLP基因,位于9条染色体上,分为4种结构类型,基因结构相对较简单;系统发育进化分析归为9个聚类组,其中聚类组5和聚类组6中的成员最多;基因启动子区发现多个与增强基因表达、激素响应和胁迫响应相关的元件;基因密码子使用偏性弱,基因进化主要受碱基突变的影响。【结论】枣基因组中含有34个TLP基因家族成员,数量相对偏少;在植物生长、果实发育和抵御胁迫过程中发挥作用;进化过程中主要受突变选择压力影响。该研究为TLP基因家族的功能分析和遗传育种应用提供了参考和借鉴。
|
| 关 键 词： | 枣 类甜蛋白 生物信息学 密码子使用性 |
Identification and bioinformatics analysis of thaumatin-like protein gene in Chinese jujube |
| |
| Abstract: | |
| |
| Keywords: | |
| 本文献已被 CNKI 等数据库收录！ |
|
