| 黄瓜MADS-box基因家族生物信息学分析及CsMADS-box AGL62的克隆 |
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| 引用本文： | 赵阳,周秀艳,辛明,秦智伟.黄瓜MADS-box基因家族生物信息学分析及CsMADS-box AGL62的克隆[J].中国蔬菜,2018,1(11):22-31. |
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| 作者姓名： | 赵阳 周秀艳 辛明 秦智伟 |
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| 作者单位： | 农业农村部东北地区园艺作物生物学与种质资源创制重点实验室，东北农业大学园艺园林学院，黑龙江哈尔滨 150030 |
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| 基金项目： | 国家重点研发计划项目子课题（2016YFD0101705） |
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| 摘 要： | 分别以全雌系D1104-2-4、强雌系D1158♀-2、雌雄异花同株D0528-2为母本,与1个雌雄异花同株父本D0708-2杂交获得杂种一代,调查开花初期、根瓜期、盛果期3个时期雌性相关农艺性状,筛选出差异显著的组合进行转录组测序分析进而分析黄瓜杂交组合间MADS-box家族的差异基因。结果表明:以全雌系D1104-2-4为母本的杂种一代C15-114在雌花数、雌花节率上均具有超亲优势,3个杂交组合F1均具有早熟的中亲优势。转录组分析结果发现,以全雌系D1104-2-4为母本的杂种一代基因表达情况显著的偏向母本,挑选的37个黄瓜MADS-box家族基因只有6个与母本有表达差异,17个与父本有表达差异。生物信息学分析并命名了1个差异最显著的基因Cs MADS-box AGL62,该基因全长745 bp,编码187个氨基酸,编码的蛋白属于线粒体中不稳定的亲水性跨膜蛋白,NCBI比对结果表明该蛋白是1个转录因子,系统进化分析发现其与甜瓜中AGL62同源性最高,在黄瓜中该蛋白和其他黄瓜AGL62亚型属于同一分支并且属于I型。
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| 关 键 词： | 雌性分化 MADS-box 家族 CsMADS-box AGL62 基因 生物信息学分析 |
Bioinformatics Analysis of Cucumber MADS-box Gene Family and Cloning of CsMADS-box AGL62 |
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| ZHAO Yang,ZHOU Xiu-yan,XIN Ming,QIN Zhi-wei.Bioinformatics Analysis of Cucumber MADS-box Gene Family and Cloning of CsMADS-box AGL62[J].China Vegetables,2018,1(11):22-31. |
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| Authors: | ZHAO Yang ZHOU Xiu-yan XIN Ming QIN Zhi-wei |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Female differentiation MADS-box family CsMADS-box AGL62 gene Bioinformatics
analysis |
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