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苹小吉丁自然种群肠道微生物多样性
引用本文:贾斐然,周忠福,赵文霞,孙荟荃,姚艳霞.苹小吉丁自然种群肠道微生物多样性[J].林业科学,2022,58(3):86-96.
作者姓名:贾斐然  周忠福  赵文霞  孙荟荃  姚艳霞
作者单位:国家林业和草原局森林保护学重点实验室 中国林业科学研究院森林生态环境与自然保护研究所 北京 100091
基金项目:国家重点研发计划项目(2016YFC0501503);
摘    要:【目的】明确不同虫态、不同环境苹小吉丁自然种群肠道真菌和细菌种类组成及其可能对宿主生长发育和生理变化的影响。【方法】分别将新疆野果林(W)和栽培果园(C)获取的成虫(A)与幼虫(L)进行完整肠道解剖,利用Illumina MiSeq技术对ITS2基因(真菌)和16S rRNA V3-V4变异区(细菌)进行测定,统计肠道微生物的操作分类单元(operational taxonomic unit, OTU)数量,分析物种丰度、组成及Alpha多样性,并运用PICRUSt2对其功能进行预测。【结果】获得苹小吉丁肠道真菌ITS2优质序列177 028条,细菌16S rRNA优质序列253 712条,聚类分析分别获得285和1 470个OTUs。最终注释到真菌5门22纲50目92科122属,细菌40门103纲231目364科594属。从属级水平来看,不同虫态、不同环境苹小吉丁肠道微生物各具特有的真菌和细菌类群,其中,其中CA特有真菌11属,特有细菌2属;CL特有真菌28属,特有细菌223属;WA特有真菌37属,特有细菌47属;WL特有真菌12属,特有细菌68属,而核心菌群中真菌7属,细菌21属。...

关 键 词:苹小吉丁  肠道微生物  高通量测序  多样性  PICRUSt2功能预测

Diversity of Gut Microorganisms in Natural Population of Agrilus mali ( Coleoptera: Buprestidae)
Jia Feiran,Zhou Zhongfu,Zhao Wenxia,Sun Huiquan,Yao Yanxia.Diversity of Gut Microorganisms in Natural Population of Agrilus mali ( Coleoptera: Buprestidae)[J].Scientia Silvae Sinicae,2022,58(3):86-96.
Authors:Jia Feiran  Zhou Zhongfu  Zhao Wenxia  Sun Huiquan  Yao Yanxia
Abstract:
Keywords:
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