| 基于月季微卫星标记的7个遗传相似系数比较 |
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| 引用本文： | 黄平,崔娇鹏,郑勇奇,张川红.基于月季微卫星标记的7个遗传相似系数比较[J].林业科学,2013,49(1):68-76. |
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| 作者姓名： | 黄平 崔娇鹏 郑勇奇 张川红 |
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| 作者单位： | 1. 国家林业局植物新品种分子测定实验室 国家林业局林木培育重点实验室 中国林业科学研究院林业研究所 北京100091
2. 北京植物园 北京100093 |
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| 基金项目： | 国家林业局科技发展中心项目(2007011);北京市科委计划项目公益应用类(D08050603770804) |
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| 摘 要： | 以月季品种的微卫星标记数据为基础,选择7个遗传相似系数对月季品种间遗传相似度进行计算,并采用非加权组平均法(UPGMA)建立相应的系统树.通过遗传相似系数相关性、聚类结果一致性以及拟合优度等分析方法,探讨不同的遗传相似系数在微卫星遗传分析中的适用性.分析数据显示7个系数之间相关系数介于0.726 ～1.000.共表型相关系数rc介于0.85～0.93,表明品种间遗传差异在基于UPGMA方法的聚类树状图中有良好体现.系统树之间的CI.指数范围为0.468 ～1.000,表明采用不同相似系数进行聚类分析时,结果存在较大差异.7个遗传相似系数的S统计值介于16.24％ ～ 29.90％,Russel and Rao系数最低,Simple Matching等3个系数S值均大于20％.综合考虑分子标记特点、物种杂合度、Kruskal拟合优度等因素,并结合聚类分析与品种谱系比较结果,研究认为Dice系数和Jaccard系数适用于月季的微卫星遗传分析,其次是Simple Matching系数.
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| 关 键 词： | 月季 品种 多倍体 微卫星标记 遗传相似系数 聚类分析 |
Comparison of 7 Genetic Similarity Coefficients Based on Microsatellite Markers in Rose Variety |
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| Huang Ping
,
Cui Jiaopeng
,
Zheng Yongqi
,
Zhang Chuanhong.Comparison of 7 Genetic Similarity Coefficients Based on Microsatellite Markers in Rose Variety[J].Scientia Silvae Sinicae,2013,49(1):68-76. |
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| Authors: | Huang Ping Cui Jiaopeng Zheng Yongqi Zhang Chuanhong |
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| Institution: | 1 (1. Laboratory of Molecular Testing for Plant Variety of State Forestry Administration Key Laboratory of Tree Breeding and Cultivation of State Forestry Administration Institute of Forestry, Chinese Academy of Forestry Beijing 100091; 2.Beijing Botanical Garden Beijing 100093) |
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