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基于毛细管电泳的日本落叶松MSAP反应体系的建立
引用本文:刁姝,孙超,孙晓梅,张守攻.基于毛细管电泳的日本落叶松MSAP反应体系的建立[J].林业科学研究,2017,30(3):361-367.
作者姓名:刁姝  孙超  孙晓梅  张守攻
作者单位:中国林业科学研究院林业研究所, 国家林业局林木培育重点实验室, 北京 100091;中国林业科学研究院林业研究所, 国家林业局林木培育重点实验室, 北京 100091;中国林业科学研究院林业研究所, 国家林业局林木培育重点实验室, 北京 100091;中国林业科学研究院林业研究所, 国家林业局林木培育重点实验室, 北京 100091
基金项目:林业公益性行业科研专项经费重点项目(20150414)
摘    要:目的]建立基于毛细管电泳的日本落叶松最佳MSAP反应体系,获得条带清晰,信号强度均一的DNA甲基化图谱,为今后开展日本落叶松表观遗传变异研究奠定基础。方法]以日本落叶松未成熟木质部为试材,设置不同梯度的DNA模板用量以及选择扩增体系中引物浓度、Mg~(2+)浓度、dNTP浓度和exTaq DNA聚合酶浓度,确定各组分不同用量对毛细管电泳效果的影响,从而确立最适的MSAP反应体系。结果]结果表明模板DNA以及exTaq DNA聚合酶浓度对毛细管电泳结果影响不明显,而高的引物浓度会引起条带的减少。Mg~(2+)及dNTP浓度是影响毛细管电泳结果最为关键的因素,浓度过低或过高会导致毛细管电泳图谱条带明显减少,杂峰显著增多。结论]最终确立的反应体系为:DNA模板100 ng,引物0.75 pmol·μL~(-1),Mg~(2+)2 mmol·L~(-1),dNTP 0.375 mmol·L~(-1)和exTaq DNA聚合酶0.05 U·μL~(-1)。

关 键 词:DNA甲基化  甲基化敏感扩增多态性(MSAP)  毛细管电泳  体系建立  日本落叶松
收稿时间:2016/9/21 0:00:00

Establishment of Larix kaempferi MSAP System Based on Capillary Electrophoresis
DIAO Shu,SUN Chao,SUN Xiao-mei and ZHANG Shou-gong.Establishment of Larix kaempferi MSAP System Based on Capillary Electrophoresis[J].Forest Research,2017,30(3):361-367.
Authors:DIAO Shu  SUN Chao  SUN Xiao-mei and ZHANG Shou-gong
Institution:Research Institute of Forestry, Chinese Academy of Forestry, Key Laboratory of Tree Breeding and Cultivation, State Forestry Administration, Beijing 100091, China;Research Institute of Forestry, Chinese Academy of Forestry, Key Laboratory of Tree Breeding and Cultivation, State Forestry Administration, Beijing 100091, China;Research Institute of Forestry, Chinese Academy of Forestry, Key Laboratory of Tree Breeding and Cultivation, State Forestry Administration, Beijing 100091, China;Research Institute of Forestry, Chinese Academy of Forestry, Key Laboratory of Tree Breeding and Cultivation, State Forestry Administration, Beijing 100091, China
Abstract:
Keywords:DNA methylation  methylation sensitive amplification polymorphism (MSAP)  capillary electrophoresis  system establishment  Larix kaempferi
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