| 红椿SSR-PCR体系建立和多态性引物筛选 |
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| 引用本文： | 湛欣,鲁好君,赵帅,陈晓阳,邓小梅.红椿SSR-PCR体系建立和多态性引物筛选[J].林业科学研究,2016,29(4):565-570. |
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| 作者姓名： | 湛欣 鲁好君 赵帅 陈晓阳 邓小梅 |
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| 作者单位： | 华南农业大学 林学与风景园林学院/广东省森林植物种质创新与利用重点实验室, 广东 广州 510642;华南农业大学 林学与风景园林学院/广东省森林植物种质创新与利用重点实验室, 广东 广州 510642;华南农业大学 林学与风景园林学院/广东省森林植物种质创新与利用重点实验室, 广东 广州 510642;华南农业大学 林学与风景园林学院/广东省森林植物种质创新与利用重点实验室, 广东 广州 510642;华南农业大学 林学与风景园林学院/广东省森林植物种质创新与利用重点实验室, 广东 广州 510642 |
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| 基金项目： | 国家林业局公益性行业专项（201004020）。 |
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| 摘 要： | 目的]本研究旨在建立红椿SSR-PCR最佳反应体系,并筛选适于红椿SSR分析的高多态性引物。方法]通过L16(45)正交试验设计,确立红椿SSR-PCR最佳反应体系;利用优化后的体系对来自楝科植物的135对SSR引物,在6个不同的红椿居群中进行扩增,筛出能有效扩增的引物并进一步筛选出适于红椿的高多态性引物。结果](1)10μL基于荧光d UTP的SSR-PCR体系中包含:10×buffer 1.0μL,Taq酶(5 U·μL-1)0.1μL,Mg Cl2(25mmol·L-1)0.8μL,d NTP(200 mmol·L-1)0.025μL,荧光d UTP(1 nmol·μL-1)0.01μL,引物(10 mmol·L-1)0.8μL,DNA模板45 ng剩余用dd H2O补足;(2)筛选出29对能有效扩增的引物,复选后获得了12对适于红椿SSR分析的高多态性引物。结论]建立了SSR-PCR最佳反应体系并筛选出高多态性引物,为红椿的分子标记等遗传学研究提供了基础。
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| 关 键 词： | SSR 红椿 体系优化 引物筛选 |
| 收稿时间： | 7/6/2015 12:00:00 AM |
Establishment and Primer Screening of SSR-PCR Reaction System for Toona ciliata |
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| ZHAN Xin,LU Hao-jun,ZHAO Shuai,CHEN Xiao-yang and DENG Xiao-mei.Establishment and Primer Screening of SSR-PCR Reaction System for Toona ciliata[J].Forest Research,2016,29(4):565-570. |
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| Authors: | ZHAN Xin LU Hao-jun ZHAO Shuai CHEN Xiao-yang and DENG Xiao-mei |
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| Institution: | College of Forestry and Landscape Architecture/Guangdong Key Laboratory for Innovative Development and Utilization of Forest Plant Germplasm, South China Agricultural University, Guangzhou 510642, Guangdong, China;College of Forestry and Landscape Architecture/Guangdong Key Laboratory for Innovative Development and Utilization of Forest Plant Germplasm, South China Agricultural University, Guangzhou 510642, Guangdong, China;College of Forestry and Landscape Architecture/Guangdong Key Laboratory for Innovative Development and Utilization of Forest Plant Germplasm, South China Agricultural University, Guangzhou 510642, Guangdong, China;College of Forestry and Landscape Architecture/Guangdong Key Laboratory for Innovative Development and Utilization of Forest Plant Germplasm, South China Agricultural University, Guangzhou 510642, Guangdong, China;College of Forestry and Landscape Architecture/Guangdong Key Laboratory for Innovative Development and Utilization of Forest Plant Germplasm, South China Agricultural University, Guangzhou 510642, Guangdong, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Toona ciliate SSR-PCR system optimization primers screening |
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