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真姬菇栽培菌株的ITS和SSR分析
引用本文:董岩,陈辉,赵明文,冯志勇. 真姬菇栽培菌株的ITS和SSR分析[J]. 上海农业学报, 2009, 25(3): 59-64
作者姓名:董岩  陈辉  赵明文  冯志勇
作者单位:1. 南京农业大学生命科学院,农业部农业微生物环境工程重点开放实验室,南京210095;农业部应用真菌资源与利用重点开放实验室,上海市农业遗传育种重点实验室,上海市食用菌工程技术研究中心,上海市农业科学院食用菌研究所,上海201106
2. 农业部应用真菌资源与利用重点开放实验室,上海市农业遗传育种重点实验室,上海市食用菌工程技术研究中心,上海市农业科学院食用菌研究所,上海201106
3. 南京农业大学生命科学院,农业部农业微生物环境工程重点开放实验室,南京210095
摘    要:采用ITS和SSR分子标记技术,对27个真姬菇菌株进行遗传分析.通过内转录间隔区(ITS)区域测定和比较分析,结果显示:供试菌株ITS序列长度为594 bp,与GenBank上登录的真姬菇菌株ITS序列相似度为99%以上,在种的水平上证明供试菌株为真姬菇.利用简单重复序列(SSR)标记技术和转移扩增技术,根据香菇、糙皮侧耳、灰盖鬼伞基因组序列设计引物,对真姬菇供试菌株基因组DNA进行扩增.从54对引物中筛选出23对能够扩增出稳定带型且菌株之间带型差异明显的SSR引物.利用23对引物对全部供试菌株进行扩增,共扩增133条条带,其中多态性条带为108条,多态性比率达到81.2%.UPGMA聚类分析结果表明:大部分常规栽培菌株和工厂化栽培菌株聚在不同组,说明两者之间的遗传背景存在明显差异.根据获得菌株的特有SSR标记分析表明:利用7对引物可以将工厂化栽培菌株区分开,其中2个工厂化栽培菌株各自具有1条特异条带,其他工厂化栽培菌株均可通过引物组合法区分开.

关 键 词:真姬菇  简单重复序列(SSR)  遗传多样性  内转录间隔区(ITS)

ITS and SSR analyses of cultured Hypsizygus marmoreus strains
DONG Yan,CHEN Hui,ZHAO Ming-wen,FENG Zhi-yong. ITS and SSR analyses of cultured Hypsizygus marmoreus strains[J]. Acta Agriculturae Shanghai, 2009, 25(3): 59-64
Authors:DONG Yan  CHEN Hui  ZHAO Ming-wen  FENG Zhi-yong
Abstract:
Keywords:
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