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芹菜EST-SSR分析
引用本文:褚云霞,黄志城,李寿国,顾可飞,陈海荣,顾晓君.芹菜EST-SSR分析[J].上海农业学报,2013,29(2).
作者姓名:褚云霞  黄志城  李寿国  顾可飞  陈海荣  顾晓君
作者单位:1. 上海市农业科学院农产品质量标准与检测技术研究所,上海201403;农业部植物新品种DUS测试(上海)分中心,上海201415;上海交通大学农业与生物学院,上海200240
2. 上海市农业科学院农产品质量标准与检测技术研究所,上海201403;农业部植物新品种DUS测试(上海)分中心,上海201415
3. 农业部植物新品种DUS测试(上海)分中心,上海,201415
摘    要:以NCBI公布的EST数据为基础,通过一系列软件处理,连接成长175.294 kb的无冗余EST序列324条,从23条序列中发现25个SSR,每7.011 kb出现1个SSR位点.运用Primer 3设计出引物15对,结合文献公布的11对引物,以46份中国芹菜品种及7份西芹品种的总DNA为材料,对EST-SSR在芹菜上的应用可行性进行验证,53份芹菜品种的12个微卫星位点共检测到32个等位基因,等位基因2(引物4)~4个(引物11),平均等位基因数为2.7个;并对53份材料的亲缘关系进行了鉴定.

关 键 词:芹菜  EST  SSR  亲缘关系

EST-SSR analysis of celery(Apium graveolens)
CHU Yun-xia , HUANG Zhi-cheng , LI Shou-guo , GU Ke-fei , CHEN Hai-rong , GU Xiao-jun.EST-SSR analysis of celery(Apium graveolens)[J].Acta Agriculturae Shanghai,2013,29(2).
Authors:CHU Yun-xia  HUANG Zhi-cheng  LI Shou-guo  GU Ke-fei  CHEN Hai-rong  GU Xiao-jun
Abstract:
Keywords:
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