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枫香树DNA提取及SRAP-PCR反应体系的建立与优化
引用本文:李芳芳,杨少宗,柳新红,李海波,王丽玲,李永华.枫香树DNA提取及SRAP-PCR反应体系的建立与优化[J].河南农业大学学报,2015(1):46-51,67.
作者姓名:李芳芳  杨少宗  柳新红  李海波  王丽玲  李永华
作者单位:河南农业大学;浙江省林业科学研究院
基金项目:林业公益性行业科研项目(201404312);浙江省重大科技项目(2012C12908-14);浙江省重大科技项目(2012C12909-21)
摘    要:通过不同处理的枫香树叶片及基因组DNA提取方法的对比,并采用L16(45)正交试验设计,对影响SRAP-PCR反应体系的Mg2+,d NTPs,引物浓度及Taq DNA聚合酶和模板DNA用量等5个因素进行优化,确立枫香树SRAP-PCR最佳反应体系。结果表明,改良CTAB法提取枫香树基因组DNA的产率和纯度均可满足下游试验需要。SRAP-PCR最优反应体系为:总体积20μL,含1×PCR Buffer,1.5 mmol·L-1Mg2+,0.16mmol·L-1d NTPs,0.5μmol·L-1引物,0.9 U Taq DNA聚合酶和40 ng模板DNA。各因素对反应结果的影响大小顺序为Taq DNA聚合酶量d NTPs浓度Mg2+浓度模板DNA用量引物浓度。运用优化的SRAPPCR反应体系对10个不同居群的枫香树基因组DNA扩增检测,结果均能获得稳定性高、多态性丰富和重复性好的条带图谱。

关 键 词:枫香树  DNA提取  SRAP-PCR  正交试验设计  反应体系优化
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