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班皮桉及其近邻树种CCR基因分子变异分析
引用本文:陈碧华,Merv Shepherd,梁一池.班皮桉及其近邻树种CCR基因分子变异分析[J].西南林学院学报,2006,26(5):1-5.
作者姓名:陈碧华  Merv Shepherd  梁一池
作者单位:1. 福建农林大学,林学院,福建,福州,350002;福建省林业科学研究院,福建,福州,350012
2. Southern Cross University,Lismore NSW 2480,Australia
3. 福建农林大学,林学院,福建,福州,350002
基金项目:致谢:本试验得到澳大利亚Southem Cross University植物遗传保护实验室和该实验室许多专家学者的帮助,得到福建省委组织部资助,在此一并表示衷心感谢!
摘    要:选取伞房属班皮桉及其近邻树种共5部类16个样本提取基因组DNA,用2对引物进行PCR扩增,采用凝胶直接纯化,改进测序反应后测序.以Eucalyptus gunniiCCR作对照,通过ClustalW进行比对分析序列变异和MEGA 3进行系统进化分析.结果显示:在所得到的伞房属16个样本CCR序列中,A,C,G和T 4种核苷酸所占比例分别为24.92%,23.18%,23.22%和28.67%,A T含量明显高于G C.共发现292个变异位点,占分析位点总数的9.71%,变异除118个转换和97个颠换外,有93个位点的插入/缺失,其中简约信息位点185个,占63.36%.部分变异位点重叠.转换与颠换比值为1.22∶1.00.CCR系统发育树显示:E.gunnii是一个单独分枝,5部类亲缘可以分辨开来,Rufaria尤其明显.Rufaria最早产生分歧,其次是Ochraria和Cadagaria,Blakearia分歧属最迟进化.

关 键 词:伞房属(哥伦比亚属)  班皮桉  肉桂酰辅酶A还原酶  分子变异  系统进化树
文章编号:1003-7179(2006)05-0001-05
收稿时间:2006-04-03
修稿时间:2006年4月3日

Molecular Variation of CCR Gene in the Spotted Gums and Its Corymbia Relatives
CHEN Bi-hua,Merv Shepherd,LIANG Yi-chi.Molecular Variation of CCR Gene in the Spotted Gums and Its Corymbia Relatives[J].Journal of Southwest Forestry College,2006,26(5):1-5.
Authors:CHEN Bi-hua  Merv Shepherd  LIANG Yi-chi
Institution:1. Forestry College, Fujian Agricultural and Forestry University, Fuzhou Fujian 350002, China; 2. Fujian Provincial Academy of Forestry Sciences, Fuzhou Fujian 350012, China; 3. Southern Cross University, Lismore NSW 2480, Australia
Abstract:
Keywords:Corymbia  spotted gum  cinnamyol Co-A reductase(CCR)  molecular variation  phylogenetic tree
本文献已被 CNKI 维普 万方数据 等数据库收录!
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