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莆田黑鸭MHCⅠ基因外显子2的遗传多态性
引用本文:汪稳,林威敏,陈静,胡宇平,毛小鸿,肖天放.莆田黑鸭MHCⅠ基因外显子2的遗传多态性[J].福建农林大学学报(自然科学版),2016(4):420-426.
作者姓名:汪稳  林威敏  陈静  胡宇平  毛小鸿  肖天放
作者单位:福建农林大学动物科学学院,福建 福州,350002
基金项目:福建省高等学校科技项目(JA09082);福建省高校产学合作科技重大项目(2012N5001)
摘    要:以莆田黑鸭为材料,对其主要组织相容性复合体(MHC)Ⅰ基因外显子2进行PCR扩增和DNA测序,分析其遗传多态性及变异特征,为进一步寻求抗病分子提供依据.结果表明,莆田黑鸭MHCⅠ基因外显子2处有丰富的遗传多态性,核苷酸变异以颠换为主,同义替换率大于非同义替换率,总GC含量较高,为59%,其中,密码子第3位的GC含量最高,为82.7%.莆田黑鸭MHCⅠ基因外显子2编码的氨基酸有明显的疏水性,对维持MHC分子的结构和功能具有重要作用.聚类分析结果表明,禽类分支中,莆田黑鸭与家鹅的亲缘关系较近,与鸡的亲缘关系较远.

关 键 词:莆田黑鸭  主要组织相容性复合体Ⅰ(MHCⅠ)  DNA测序  遗传多态性
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