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均匀设计优化猕猴桃SRAP体系
引用本文:王卫,陈义挺,陈婷,黄新忠,陈小明,胡薇.均匀设计优化猕猴桃SRAP体系[J].福建农林大学学报(自然科学版),2013,42(1).
作者姓名:王卫  陈义挺  陈婷  黄新忠  陈小明  胡薇
作者单位:1. 福建师范大学生命科学学院,福建福州350108;福建省农业科学院果树所,福建福350013
2. 福建省农业科学院果树所,福建福,350013
3. 福建师范大学生命科学学院,福建福州,350108
基金项目:国家科技支撑计划项目,福建省农业科学院科技创新团队重点科研项目,福建省农业科学院双百行动项目
摘    要:采用均匀设计对影响猕猴桃SRAP-PCR体系的5种因素(Mg2+、dNTPs、引物、Taq DNA聚合酶、模板DNA)进行5因素5水平和5因素3水平的两轮优化,建立猕猴桃SRAP-PCR的最佳体系(25μL):Mg2+2.50 mmol·L-1,dNTPs 0.25 mmol·L-1,引物0.2μmol·L-1,Taq DNA聚合酶1.25 U,模板DNA 150 ng.扩增程序为:94℃预变性5 min;94℃变性1 min,35℃复性1 min,72℃延伸1 min,5个循环;94℃变性1 min,53℃复性1 min,72℃延伸1 min,33个循环,72℃延伸10 min.

关 键 词:猕猴桃  SRAP  均匀设计  优化

Uniform design optimization of SRAP-PCR system in Actinidia chinensis
WANG Wei , CHEN Yi-ting , CHEN Ting , HUANG Xin-zhong , CHEN Xiao-ming , HU Wei.Uniform design optimization of SRAP-PCR system in Actinidia chinensis[J].Journal of Fujian Agricultural and Forestry University,2013,42(1).
Authors:WANG Wei  CHEN Yi-ting  CHEN Ting  HUANG Xin-zhong  CHEN Xiao-ming  HU Wei
Abstract:Uniform design was used to optimize SRAP-PCR system in Actinidia chinensis,which included two rounds of optimization.Five influencing factors on SRAP-PCR,including the concentration of Mg2+,dNTPs,primers,Taq DNA polymerase and DNA template were optimized.The results showed that the optimum SRAP-PCR system included Mg2+ 2.50 mmol·L-1,dNTPs 0.25 mmol·L-1,primers 0.2 μmol·L-1,Taq DNA polymerase 1.25 U and DNA template 150 ng in the 25 μL reaction system.The suitable SRAP-PCR protocol was initial denaturing at 94 ℃ for 5 min,then pre-amplifying at 94 ℃ for 1 min,35 ℃ for 1 min,72 ℃ for 1 min for 5 cycles,amplifying for 33 cycles when the annealing temperature was adjusted to 53 ℃,finally extending at 72 ℃ for 10 min.
Keywords:Actinidia chinensis  SRAP  uniform design  optimization
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