| 基于高通量测序的山羊卵巢基质、卵泡转录组分析 |
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| 引用本文： | 陆婷婷,邹娴,杨镇玮,雷放,陈奕业,柳广斌,孙宝丽,刘德武,李耀坤.基于高通量测序的山羊卵巢基质、卵泡转录组分析[J].华南农业大学学报,2020,41(2):23-32. |
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| 作者姓名： | 陆婷婷 邹娴 杨镇玮 雷放 陈奕业 柳广斌 孙宝丽 刘德武 李耀坤 |
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| 作者单位： | 华南农业大学动物科学学院,广东广州510642;华南农业大学动物科学学院,广东广州510642;广东省农业科学院动物科学研究所/畜禽育种国家重点实验室/广东省畜禽育种与营养研究重点实验室,广东广州510640 |
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| 基金项目： | 广东省教育厅青年创新人才项目（2017KQNCX014）；广东省公益研究与能力建设项目（2017B020201014，2017A020208050） |
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| 摘 要： | 【目的】比较山羊Capra hircus卵巢基质、大卵泡和小卵泡间的m RNA表达图谱,为探究卵泡发育机制提供一定的研究基础。【方法】采用高通量测序技术对发情期川中黑山羊的卵巢基质、大卵泡和小卵泡进行转录组测序,利用生物信息学方法检测mRNA表达谱,筛选差异基因,对其进行GO和KEGG通路分析,最后随机抽取5个差异基因进行荧光定量PCR验证。【结果】卵巢基质vs大卵泡、卵巢基质vs小卵泡和小卵泡vs大卵泡的差异表达基因分别为524、180和403个。筛选出INHA、TNFRSF19等15个与卵泡发育相关的基因,其主要富集在内质网蛋白质加工、类固醇生物合成、卵母细胞减数分裂等信号通路。通过q RT-PCR验证,定量结果与测序结果基本一致。【结论】川中黑山羊卵巢基质、大卵泡和小卵泡的基因表达模式不同,小卵泡与卵巢基质的基因表达模式更相近。
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| 关 键 词： | 山羊 卵巢基质 卵泡 转录组 高通量测序 |
| 收稿时间： | 2019/5/5 0:00:00 |
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