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用于荔枝qPCR分析的内参基因克隆及稳定性分析
引用本文:魏永赞,赖彪,胡福初,李晓静,胡桂兵,王惠聪.用于荔枝qPCR分析的内参基因克隆及稳定性分析[J].华南农业大学学报,2012,33(3):301-306.
作者姓名:魏永赞  赖彪  胡福初  李晓静  胡桂兵  王惠聪
作者单位:1. 华南农业大学园艺学院,南方果树生理研究室,广东广州510642;中国热带农业科学院南亚热带作物研究所,广东湛江524091
2. 华南农业大学园艺学院,南方果树生理研究室,广东广州510642
3. 华南农业大学园艺学院,南方果树生理研究室,广东广州510642;海南省农业科学院果树研究所,海南海口571100
基金项目:国家自然科学基金,国家科技支撑计划项目,现代农业产业技术体系建设专项资金
摘    要:利用基因克隆和测序,从‘妃子笑’荔枝果皮中获得了β-Actin、GAPDH和18S rRNA 3个qPCR分析常用的内参基因全长序列,其长度分别为1 273、1 368和1 712 bp;3个基因与其他物种高度同源,氨基酸序列相似性均超过了98%.在此基础上,结合已报道的UBQ、eEF和25S rRNA 3个常用的内参基因,对β-Actin、GAPDH、18S rRNA,UBQ、eEF和25S rRNA 6个常用内参基因在荔枝果实发育不同阶段和外源生长调节剂处理后表达稳定性进行了分析,同时比较了geNorm、Norm Finder和BestKeeper 3种不同算法的差异.结果表明:以上6个基因中,β-Actin基因在3种不同算法下均保持了较好的表达稳定性.

关 键 词:荔枝  qPCR  内参基因  克隆  稳定性分析
收稿时间:2011/11/8 0:00:00

Cloning and Stability Analysis of Reference Genes for Expression Studies by Quantitative Real-Time PCR in Litchi
WEI Yong-zan,LAI Biao,HU Fu-chu,LI Xiao-jing,HU Gui-bing and WANG Hui-cong.Cloning and Stability Analysis of Reference Genes for Expression Studies by Quantitative Real-Time PCR in Litchi[J].Journal of South China Agricultural University,2012,33(3):301-306.
Authors:WEI Yong-zan  LAI Biao  HU Fu-chu  LI Xiao-jing  HU Gui-bing and WANG Hui-cong
Institution:1(1 Physiological Laboratory for South China Fruits,College of Horticulture,South China Agricultural University, Guangzhou 510642,China;2 The South Subtropical Crops Research Institute,Chinese Academy of Tropical Agricultural Sciences,Zhanjiang,524091,China;3 Institute of Tropical Fruit Trees,Hainan Academy of Agricultural Sciences,Haikou 571100,China)
Abstract:
Keywords:Litchi chinensis  qPCR  reference genes  cloning  stability analysis
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