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灰葡萄孢Bctre1的基因组定位、蛋白质结构预测及表达分析
引用本文:沈彦辉,陈宏坤,高璐阳,徐广飞,付强强.灰葡萄孢Bctre1的基因组定位、蛋白质结构预测及表达分析[J].山东农业科学,2020,52(3).
作者姓名:沈彦辉  陈宏坤  高璐阳  徐广飞  付强强
作者单位:金正大生态工程集团股份有限公司/养分资源高效开发与综合利用国家重点实验室,山东 临沭 276700;金正大生态工程集团股份有限公司/养分资源高效开发与综合利用国家重点实验室,山东 临沭 276700;广东金正大生态工程有限公司/广东省缓控释肥工程技术研究中心,广东 清远 513402
基金项目:清远市创新创业科研团队项目;清远市科技计划
摘    要:本研究选取灰葡萄孢菌株BC 05.10为试材,克隆Bctre1基因的核苷酸序列并对其进行生物信息学分析,同时采用荧光定量PCR法研究该基因在不同侵染时期、分生孢子萌发过程中以及不同碳源、海藻糖诱导下的表达情况。结果表明:该基因ID号为5428296,全长3 341 bp,位于scaffold_17负链的495 880~499 211位置,与核盘菌Sstre1的同源关系较近; BcTRE1蛋白由1 033个氨基酸残基编码组成,该蛋白N端具有2个6发卡结构的超糖苷酶家族和1个C端糖基水解酶家族63。荧光定量PCR结果显示,随着侵染时间的延长Bctre1表达量显著增加(P0.05),48 h后表达量增加不显著;Bctre1在分生孢子萌发24 h时表达量最高;Bctre1在海藻糖为单一碳源的培养基中表达量最高,在海藻糖诱导下12 h后Bctre1表达量显著增加(P0.05)。综上,Bctre1与侵染寄主过程中分生孢子萌发及不同碳源利用密切相关,在侵染后期对促进菌丝生长发挥重要作用。

关 键 词:灰葡萄孢  Bctre1  基因组定位  蛋白结构  表达分析
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