利用 ｍｔＤＮＡＤ-ｌｏｏｐ序列为遗传标记分析槟榔江水牛的群体遗传特征

槟榔江水牛是近年在云南西部发现的中国第一个本土河流型水牛群体，具有较高种用价值，但其重要遗传背景信息还不清楚。本文采用 ＰＣＲ产物直接测序法对 ８６头槟榔江水牛 ｍｔＤＮＡＤ-Ｌｏｏｐ序列进行了突变检测，并以 ＧｅｎＢａｎｋ上已发表的 ７０条河流型和 １１２条沼泽型水牛 ｍｔＤＮＡＤ Ｌｏｏｐ序列为对照，对所得数据进行群体遗传和系统发育分析。结果在槟榔江水牛中检测到 ３３种单倍型，１１２个多态位点。其中单一变异位点 １４个，简约信息位点 ９８个。槟榔江水牛 ｍｔＤＮＡＤ Ｌｏｏｐ序列 Ｔ，Ｃ，Ａ，Ｇ的平均含量分别为 ２８.４３％，２４.８２％，３１.９６％，１４.７９％，单倍型多样度为 （０.９４８±０.０１２），核苷酸多样度为 （０.０３８１±０.００１６），序列间平均核苷酸差异数为３３.２８８，群体内平均遗传距离为 （０.０４３±０.００５）。系统发育、中介网络图和群体遗传关系分析表明，槟榔江水牛含有两个差异显著的母系世系组分，其中一个为河流型世系，在群体中占 ６１.６３％；另一个为沼泽型世系，在群体中占３８３７％，而其沼泽型世系可进一步分为 Ａ，Ｂ，Ｃ３个支系，其中，Ｃ为在水牛中新发现的支系，其频率极低。结果揭示了槟榔江水牛群体遗传多样性丰富，但该群体存在一定的沼泽型水牛基因渗入。