| DEV核衣壳蛋白二级结构与B细胞表位预测 |
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| 引用本文： | 代淑燕,程振涛,汪德生,文明,周碧君.DEV核衣壳蛋白二级结构与B细胞表位预测[J].贵州大学学报(农业与生物科学版),2008,27(4). |
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| 作者姓名： | 代淑燕 程振涛 汪德生 文明 周碧君 |
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| 作者单位： | 1. 贵州大学,动物科学学院,贵州,贵阳,550025
2. 贵州大学,动物科学学院,贵州,贵阳,550025;贵州大学,动物疫病研究所,贵州,贵阳,550025 |
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| 摘 要： | 为预测和分析鸭肠炎病毒NP蛋白的二级结构和B细胞表位，以DEV-NP基因推导的氨基酸序列为基础。采用Chou-Fasman法、Ganmier-Robson法和Karplus-Schulz法预测该蛋白二级结构；按Kyte—Doolittle方案、Emini方案和Jameson-Wolf方案预测其B细胞抗原表位。结果表明，DEV-NP蛋白的二级结构较为复杂，含有较多的转角、无规则卷曲等柔性区域以及α-螺旋与β-折叠区段，且在蛋白肽链中有多个区段可形成B细胞抗原表位，其中第10—15和182—186区段及其附近可能是DEV-NP蛋白的B细胞表位优势区。
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| 关 键 词： | 鸭肠炎病毒 核衣壳蛋白 二级结构 B细胞抗原表位 |
Prediction of secondary structure and B cell epitope for nucleocapsid protein of duck plague virus |
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| DAI Shu-yan,CHENG Zhen-tao,WANG De-sheng,WEN Ming,ZHOU Bi-jun.Prediction of secondary structure and B cell epitope for nucleocapsid protein of duck plague virus[J].Journal of Mountain Agriculture & Biology,2008,27(4). |
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| Authors: | DAI Shu-yan CHENG Zhen-tao WANG De-sheng WEN Ming ZHOU Bi-jun |
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