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PCR-DGGE技术用于猪场沼气池细菌群落分析的条件优化
引用本文:魏勇,王红宁,廖党金,伍志伟,管仲斌.PCR-DGGE技术用于猪场沼气池细菌群落分析的条件优化[J].农业环境科学学报,2011,30(3).
作者姓名:魏勇  王红宁  廖党金  伍志伟  管仲斌
作者单位:1. 四川农业大学动物医学院,四川雅安625014;四川省畜牧科学研究院,成都,610066
2. 四川大学生命科学学院,成都,610064
3. 四川省畜牧科学研究院,成都,610066
基金项目:四川省畜牧科学研究院基本科研业务费专项,四川生猪产业技术体系创新团队项目,省财政良种繁育专项
摘    要:本研究采用变性梯度凝胶电泳(PCR-DGGE)技术研究猪场沼气池细菌群落,对基于16S rDNA V3区的PCR-DGGE电泳的最佳变性剂梯度范围、电泳时间、染色时间进行优化.研究结果表明,最佳变性剂梯度范围为35%~60%,电泳时间为12 h,SYBR(R)Green Fluorescent Dye染料的染色时间是30 min,优化后的PCR-DGGE确保了实验的准确性、灵敏度和可重复性.运用此优化后的PCR-DGGE技术对5个猪场沼液细菌群落进行了研究,获得了较丰富的多样性.该实验为深入研究畜禽养殖粪污治理的菌种筛选奠定了基础.

关 键 词:猪场  沼气池  细菌群落

Optimization of Denaturing Gradient Gel Electrophoresis for Bacterial Communities in Biogas Slurry of Pig Farm
WEI Yong,WANG Hong-ning,LIAO Dang-jin,WU Zhi-wei,GUAN Zhong-bin.Optimization of Denaturing Gradient Gel Electrophoresis for Bacterial Communities in Biogas Slurry of Pig Farm[J].Journal of Agro-Environment Science( J. Agro-Environ. Sci.),2011,30(3).
Authors:WEI Yong  WANG Hong-ning  LIAO Dang-jin  WU Zhi-wei  GUAN Zhong-bin
Abstract:
Keywords:PCR-DGGE
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