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磷脂脂肪酸生物标记法分析养猪发酵床微生物群落结构的空间分布
引用本文:郑雪芳,刘波,朱育菁,王阶平,陈倩倩,魏云华.磷脂脂肪酸生物标记法分析养猪发酵床微生物群落结构的空间分布[J].农业环境科学学报,2018,37(4):804-812.
作者姓名:郑雪芳  刘波  朱育菁  王阶平  陈倩倩  魏云华
作者单位:福建省农业科学院农业生物资源研究所;福建省农业科学院农业工程技术研究所
基金项目:国家公益性行业(农业)科研专项(201303094);福建省科技重大专项(2015NZ0003-1);福建省农科院科技创新团队项目(STIT2017-1-11)
摘    要:采用磷脂脂肪酸(Phospholipid Fatty Acids,PLFA)生物标记法分析发酵床大栏养猪微生物群落结构的空间分布特点。从发酵床的5个区域(A、B、C、D、E)和3个层次(表层、中间层和底层)采集垫料样品,利用Sherlock MIS 4.5系统分析各样品的PLFA。结果表明,15:00、17:00、a15:0等7种PLFA在各样品中均有分布,为完全分布型,而a12:0和17:1 w6分别只在A区和B区分布,为不完全分布型。指示细菌、真菌、放线菌、革兰氏阳性细菌(G+)、革兰氏阴性细菌(G-)的PLFA及总PLFA在D区表层分布量最大。在各垫料中,PLFA分布量均表现为细菌真菌放线菌。A区各层次的真菌/细菌比值显著高于其他区域(P0.05),而G+/G-比值则显著低于其他区域(P0.05)。多样性分析表明,不同区域和层次的垫料Simpson指数、Shannon指数和Pielou指数值均呈现显著差异(P0.05)。聚类分析表明,当兰氏距离为117.1时,可将各样品聚为两个类群:类群Ⅰ包含A区的垫料,其特征是指示不同微生物的PLFA种类少和含量低;类群Ⅱ包含其他4个区域的垫料。当兰氏距离为23.4时,B区和D区各层次样本聚在同一亚类群中,其PLFA种类多、含量高,而C区和E区各层次样本聚在另一亚类群中,其PLFA含量中等。主成分分析表明,主成分1和主成分2基本能将发酵床不同空间垫料样本区分出来,其中A区单独归在一类群,D区和B区归在一类群,C区和E区归在一类群,与聚类分析结果一致。综上,发酵床大栏养猪不同空间的微生物种群结构不同,A区微生物种类少、含量低,而B区和D区微生物种类多、含量高。

关 键 词:发酵床  大栏养猪  微生物群落结构  磷脂脂肪酸(PLFA)
收稿时间:2017/9/8 0:00:00

Spatial distribution of microbial communities in a fermentation bed based on phospholipid fatty acid biomarkers
ZHENG Xue-fang,LIU Bo,ZHU Yu-jing,WANG Jie-ping,CHEN Qian-qian and WEI Yun-hua.Spatial distribution of microbial communities in a fermentation bed based on phospholipid fatty acid biomarkers[J].Journal of Agro-Environment Science( J. Agro-Environ. Sci.),2018,37(4):804-812.
Authors:ZHENG Xue-fang  LIU Bo  ZHU Yu-jing  WANG Jie-ping  CHEN Qian-qian and WEI Yun-hua
Institution:Agricultural Bio-Resources Institute, Fujian Academy of Agricultural Sciences, Fuzhou 350003, China,Agricultural Bio-Resources Institute, Fujian Academy of Agricultural Sciences, Fuzhou 350003, China,Agricultural Bio-Resources Institute, Fujian Academy of Agricultural Sciences, Fuzhou 350003, China,Agricultural Bio-Resources Institute, Fujian Academy of Agricultural Sciences, Fuzhou 350003, China,Agricultural Bio-Resources Institute, Fujian Academy of Agricultural Sciences, Fuzhou 350003, China and Agricultural Engineering and Technology Institute, Fujian Academy of Agricultural Sciences, Fuzhou 350003, China
Abstract:
Keywords:fermentation bed  pig rearing  microbial community structure  phospholipid fatty acids(PLFA)
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