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不结球白菜热激蛋白BcHSP81-4基因原核表达及生物信息学
引用本文:刘同坤,李英,王枫,孙菲菲,张蜀宁,侯喜林.不结球白菜热激蛋白BcHSP81-4基因原核表达及生物信息学[J].江苏农业学报,2011,27(3).
作者姓名:刘同坤  李英  王枫  孙菲菲  张蜀宁  侯喜林
作者单位:南京农业大学作物遗传与种质创新国家重点实验室,江苏南京210095;农业部南方蔬菜遗传改良重点开放实验室,江苏南京210095;南京农业大学园艺学院,江苏南京210095
基金项目:国家“973”计划子课题(2009CB119001-04);教育部新世纪优秀人才支持计划项目
摘    要:从不结球白菜Pol_CMS胞质不育系SSH差减文库中得到1条热激蛋白基因的EST序列,通过对该基因的NCBI网上BLAST比对发现,与热激蛋白的同源性最高,与拟南芥HSP81-4(AT5G56000)同源性高达96%,命名为BcHSP81-4。将BcHSP81-4基因片段连接到原核表达载体PGEX-4T-3,转化大肠杆菌BL21(DE3)后诱导重组蛋白的表达。经IPTG诱导后进行SDS-PAGE电泳,产生了预期大小的重组蛋白,进一步证明了该基因属于热激蛋白90家族。并采用生物信息学方法,利用多种在线软件对不结球白菜热激蛋白BcHSP81-4的理化性质、亲水性、跨膜区、亚细胞定位及蛋白质结构进行预测和分析。理化性质分析结果显示,该蛋白质含699个氨基酸,分子量为80 050,理论等电点pI值为4.95。TMpred跨膜分析结果显示,它含有1个显著的跨膜螺旋区,这个区域与ProtScale预测的疏水区基本对应。用TargetP server和WOLFPSORT server程序预测该蛋白质为细胞质蛋白质,二级结构以α-螺旋和随机卷曲为主。

关 键 词:不结球白菜  BcHSP81-4  原核表达  生物信息学

Prokaryotic expression and bioinformatic analysis of heat shock protein BcHSP81-4 gene from non-heading Chinese cabbage
LIU Tong-kun,LI Ying,WANG Feng,SUN Fei-fei,ZHANG Shu-ning,HOU Xi-lin.Prokaryotic expression and bioinformatic analysis of heat shock protein BcHSP81-4 gene from non-heading Chinese cabbage[J].Jiangsu Journal of Agricultural Sciences,2011,27(3).
Authors:LIU Tong-kun  LI Ying  WANG Feng  SUN Fei-fei  ZHANG Shu-ning  HOU Xi-lin
Abstract:
Keywords:
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