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胚胎附植期梅山猪EphrinA1全编码区克隆及生物信息学分析
引用本文:周艳红,付言峰,赵为民,刘红林,任守文.胚胎附植期梅山猪EphrinA1全编码区克隆及生物信息学分析[J].江苏农业学报,2015,31(2).
作者姓名:周艳红  付言峰  赵为民  刘红林  任守文
作者单位:1. 南京农业大学动物科技学院,江苏南京210095;江苏省农业科学院畜牧研究所/动物品种改良和繁育重点实验室,江苏南京210014
2. 江苏省农业科学院畜牧研究所/动物品种改良和繁育重点实验室,江苏南京,210014
3. 南京农业大学动物科技学院,江苏南京,210095
基金项目:国家自然科学基金项目,江苏省农业科技自主创新基金项目,国家生猪现代产业技术体系南京综合试验站项目,江苏省科技支撑计划项目
摘    要:为了研究促红细胞生成素产生肝细胞配体A1(Ephrin A1)对梅山猪胚胎附植期胚胎在子宫内膜间迁移和对子宫内膜黏附活动的影响,利用克隆测序、生物信息学和qRT-PCR方法,克隆了Ephrin A1基因的全长编码序列,对其表达的蛋白结构和功能进行了预测,并检测了其mRNA表达变化。梅山猪Ephrin A1基因编码区有5个c SNPs变异,其中2个导致氨基酸突变,分别为Glu29Asn和Trp33Arg,位于Ephrin A1外显子1和外显子2上。Ephrin A1编码序列中含5个外显子,编码205个氨基酸。Ephrin A1为不稳定的亲水性蛋白,有1个信号肽和一个保守区域,无跨膜区。另外,Ephrin A1在梅山猪胚胎附植期有较强的mRNA表达。表明Ephrin A1基因可能参与梅山猪的胚胎附植调控,其c SNPs有望成为影响猪产仔数基因的潜在分子标记。

关 键 词:梅山猪  胚胎附植  EphrinA1  克隆  生物信息学

Coding sequence cloning and bioinformatics analysis of EphrinA1 during embryo implantation in Meishan swine
ZHOU Yan-hong,FU Yan-feng,ZHAO Wei-min,LIU Hong-lin,REN Shou-wen.Coding sequence cloning and bioinformatics analysis of EphrinA1 during embryo implantation in Meishan swine[J].Jiangsu Journal of Agricultural Sciences,2015,31(2).
Authors:ZHOU Yan-hong  FU Yan-feng  ZHAO Wei-min  LIU Hong-lin  REN Shou-wen
Abstract:
Keywords:Meishan swine  embryo implantation  EphrinA1  cloning  bioinformatics
本文献已被 CNKI 万方数据 等数据库收录!
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