| 基于候选基因开发gSSR标记加密黄花菜和萱草种间遗传图谱 |
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| 引用本文： | 高阳,侯非凡,熊雄,公菲菲,王金耀,邢国明,李森.基于候选基因开发gSSR标记加密黄花菜和萱草种间遗传图谱[J].江苏农业学报,2021,37(1):139-149. |
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| 作者姓名： | 高阳 侯非凡 熊雄 公菲菲 王金耀 邢国明 李森 |
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| 作者单位： | 山西农业大学园艺学院,山西 太谷 030801;大同黄花产业发展研究院,山西 大同 037004;山西农业大学园艺学院,山西 太谷 030801;大同黄花产业发展研究院,山西 大同 037004;山西省设施蔬菜产业提质增效协同创新中心,山西 太谷 030801;山西农业大学园艺学院,山西 太谷 030801;大同黄花产业发展研究院,山西 大同 037004;山西农业大学园艺学院,山西 太谷 030801;大同黄花产业发展研究院,山西 大同 037004;山西农业大学园艺学院,山西 太谷 030801;大同黄花产业发展研究院,山西 大同 037004;山西省设施蔬菜产业提质增效协同创新中心,山西 太谷 030801;山西农业大学园艺学院,山西 太谷 030801;大同黄花产业发展研究院,山西 大同 037004;山西省设施蔬菜产业提质增效协同创新中心,山西 太谷 030801;山西农业大学园艺学院,山西 太谷 030801;大同黄花产业发展研究院,山西 大同 037004;山西省设施蔬菜产业提质增效协同创新中心,山西 太谷 030801 |
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| 基金项目： | 山西省高等学校科技创新项目;山西农业大学青年拔尖创新人才支持计划项目;山西省农业重点研发计划重点项目 |
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| 摘 要： | 为了更加精准地开展黄花菜基因组组装和性状定位,在课题组前期构建的大同黄花×摇篮曲种间遗传图谱的基础上,基于大同黄花全基因组和转录组数据库,针对秋水仙碱及昼夜节律2个关键性状所涉及的候选Unigene开发基因组SSR标记,进一步通过55个F1后代加密图谱.结果表明,新开发的95个gSSR标记中有46个标记在亲本及子代间具有多态性,多态性比例为48.42％,有22个gSSR标记到图谱上,同时有12个前期未上图的EST-SSR标记加密到新图谱.加密后的遗传图谱包含255个标记,由9个连锁群组成,总图距为3142.64 cM,平均图距为11.88 cM,各连锁群标记数量为5～58个.研究结果为进一步研究黄花菜秋水仙碱含量及昼夜节律的功能基因定位奠定了重要基础.
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| 关 键 词： | 黄花菜 gSSR 标记开发 图谱加密 |
Enhancement of the interspecific genetic map density for Hemerocallis cit-rina and H. fulva by developing gSSR markers based on candidate genes |
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| GAO Yang,HOU Fei-fan,XIONG Xiong,GONG Fei-fei,WANG Jin-yao,XING Guo-ming,LI Sen.Enhancement of the interspecific genetic map density for Hemerocallis cit-rina and H. fulva by developing gSSR markers based on candidate genes[J].Jiangsu Journal of Agricultural Sciences,2021,37(1):139-149. |
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| Authors: | GAO Yang HOU Fei-fan XIONG Xiong GONG Fei-fei WANG Jin-yao XING Guo-ming LI Sen |
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