银杏bHLH家族转录因子生物信息学及表达分析 |
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引用本文: | 冯磊,石元豹,汪贵斌,曹福亮.银杏bHLH家族转录因子生物信息学及表达分析[J].江苏农业学报,2019(2). |
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作者姓名: | 冯磊 石元豹 汪贵斌 曹福亮 |
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作者单位: | 南京林业大学南方现代林业协同创新中心;南京林业大学林学院 |
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摘 要: | 以银杏基因组数据为基础,对银杏bHLH转录因子进行筛选和分析,从银杏基因组中鉴定出72条bHLH转录因子。进一步分析发现,不同bHLH转录因子序列长度和分子量差异较大,而理论等电点及亲水性等比较接近;各家族成员均含有N端碱性氨基酸区和C端的螺旋-环-螺旋区;该家族可分为17个亚家族,相同亚家族成员保守基序的类型十分相似。通过启动子分析发现,多数银杏bHLH基因启动子均含有光响应元件、激素响应元件和逆境胁迫响应元件等。表达分析结果显示,有7条银杏bHLH基因的表达具有组织特异性,有6条基因在各组织中表达水平都比较高,预测其在银杏生物学过程中具有十分重要的作用。
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