| 一株高效降解血液蛋白的枯草芽孢杆菌NWMCC0137全基因组测序及分析 |
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| 引用本文： | 刘高强,李新鹏,刘文钊,周魏,彭乔烽,周雪雁,默罕默德·索布瑞·塔克瑞夫,丁功涛.一株高效降解血液蛋白的枯草芽孢杆菌NWMCC0137全基因组测序及分析[J].江苏农业学报,2023(7):1460-1471. |
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| 作者姓名： | 刘高强 李新鹏 刘文钊 周魏 彭乔烽 周雪雁 默罕默德·索布瑞·塔克瑞夫 丁功涛 |
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| 作者单位： | 1. 西北民族大学生物医学研究中心中国-马来西亚国家联合实验室;2. 西北民族大学生命科学与工程学院;3. 西北民族大学化工学院;4. 马来西亚国立大学工程与建筑环境学院化工系 |
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| 摘 要： | NWMCC0137是从屠宰场下水道污泥中分离获得的1株高效分解血液蛋白并具有良好生物防控特性的枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis)。为探究枯草芽孢杆菌NWMCC0137(B.subtilis NWMCC0137)高效水解血液蛋白机制及挖掘次级代谢产物编码基因资源，利用DNBSEQ与PacBio测序平台对其进行全基因组测序并进行序列组装和基因预测、功能注释、比较基因组分析。结果表明B.subtilis NWMCC0137的基因组长度为4 215 585 bp, G+C含量为44.23%;编码基因总长度为3 711 885 bp,编码4 384个基因，编码序列占整个基因组长度的88.05%,非编码RNA中包含85个tRNA基因。在KEGG数据库中B.subtilis NWMCC0137基因组被注释到7种胞外蛋白酶编码基因，其中与丝氨酸蛋白酶相关的编码基因有8个。通过antiSMASH预测发现，菌株NWMCC0137基因组中包含7种与已知次生代谢产物合成基因簇相似度为100%的基因簇，包括产孢致死因子、聚酮类化合物、丰原素、枯草芽孢杆菌素168、儿茶酚型嗜铁素、芽孢杆菌素、杆菌...
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| 关 键 词： | 枯草芽孢杆菌 全基因组 基因功能注释 蛋白酶 |
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