| 人类PGAM基因的电子克隆及生物信息学分析 |
| |
| 引用本文： | 唐军,邓武军,李仕新.人类PGAM基因的电子克隆及生物信息学分析[J].仲恺农业技术学院学报,2012,25(2). |
| |
| 作者姓名： | 唐军 邓武军 李仕新 |
| |
| 作者单位： | 1. 仲恺农业工程学院生命科学学院,广东广州,510225
2. 长沙水文水资源勘测局,湖南长沙,410014 |
| |
| 摘 要： | 采用生物信息学的方法,从UniGene簇Hs.632918中选择1条人磷酸甘油酸变位酶（Phosphoglycerate mu-tase,PGAM）的表达序列标签（Expressed sequence tag,EST）AY007118.1作为种子序列进行电子步移,得到一长为2 750 bp的cDNA序列.对其进行开放阅读框（Open reading frame,ORF）分析,发现该cDNA序列具有完整的ORF框架,ORF长度765 bp,共编码254个氨基酸.cDNA 5’端具有Kozak序列、TATA盒和CAAT框,3’端具有加尾信号和Poly A尾巴.对该序列进行限制性酶切位点、CpG岛、基因定位分析,结果发现了81个酶切位点,一个长度为627 bp、GC含量为55%、Y值为0.695的CpG岛,最后将该基因定位于第12号染色体的长臂上.同时对PGAM蛋白的二级结构和特殊结构进行了初步预测.结果显示,PGAM蛋白中存在α螺旋、β-折叠片和无规卷曲结构,没有跨膜结构的片段,无信号肽,蛋白定位于细胞质或细胞核.
|
| 关 键 词： | 生物信息学 人磷酸甘油酸变位酶 表达序列标签 UniGene 电子步移 |
In silicon cloning and bioinformatical analysis of the human PGAM gene |
| |
| Abstract: | |
| |
| Keywords: | bioinformatics human phosphoglycerate mutase(PGAM) expressed sequence tag(EST) UniGene electronic walking |
| 本文献已被 万方数据 等数据库收录！ |
|
