| 甘蔗鞭黑粉菌致病力差异菌株转录组分析 |
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| 引用本文： | 吴佳,李惠中,邓权清,陈健文,沈万宽.甘蔗鞭黑粉菌致病力差异菌株转录组分析[J].华中农业大学学报,2020,39(3):54-59. |
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| 作者姓名： | 吴佳 李惠中 邓权清 陈健文 沈万宽 |
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| 作者单位： | 华南农业大学农学院/农业农村部华南地区作物栽培科学观察实验站,广州 510642;华南农业大学农学院/农业农村部华南地区作物栽培科学观察实验站,广州 510642;华南农业大学农学院/农业农村部华南地区作物栽培科学观察实验站,广州 510642;华南农业大学农学院/农业农村部华南地区作物栽培科学观察实验站,广州 510642;华南农业大学农学院/农业农村部华南地区作物栽培科学观察实验站,广州 510642 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金项目（31771861）; 广东省甘蔗剑麻产业技术体系创新团队项目（2019KJ104-07） |
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| 摘 要： | 为探明甘蔗鞭黑粉菌不同致病力菌株在转录水平的差异,挖掘致病相关基因,采用Illumina测序技术对2个不同致病力菌株Ss16(强致病力)和Ss47(弱致病力)构建cDNA文库,进行转录组测序,通过质控后对其进行生物信息学分析。结果显示:共获得8.31G(Ss16)和9.88G(Ss47)的分析数据(clean reads),Ss16和Ss47相比较共获得显著(P0.05)差异表达基因649个,其中上调基因299个,下调基因350个。差异性表达基因的GO注释及KEGG通路富集分析结果表明,KEGG通路多与物质的蛋白合成、运输和代谢相关,富集最显著的前几条通路分别为:淀粉和蔗糖代谢(starch and sucrose metabolism)、ABC转运蛋白(ABC transporters)、芳香族化合物的降解(degradation of aromatic compounds)、代谢途径(metabolic pathways)和嘌呤代谢(purine metabolism)。
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| 关 键 词： | 甘蔗 鞭黑粉菌 转录组 致病相关基因 差异表达基因 生物信息学分析 |
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