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鳗鲡病原菌16SrRNA基因序列测定及系统进化分析
引用本文:马 英,关瑞章,郭松林,邓德波,张俊荣.鳗鲡病原菌16SrRNA基因序列测定及系统进化分析[J].华中农业大学学报,2010,29(6):758-763.
作者姓名:马 英  关瑞章  郭松林  邓德波  张俊荣
作者单位:集美大学水产学院/福建省高校水产科学技术与食品安全重点实验室,厦门 361021;集美大学水产学院/福建省高校水产科学技术与食品安全重点实验室,厦门 361021;集美大学水产学院/福建省高校水产科学技术与食品安全重点实验室,厦门 361021;集美大学水产学院/福建省高校水产科学技术与食品安全重点实验室,厦门 361021;集美大学水产学院/福建省高校水产科学技术与食品安全重点实验室,厦门 361021
基金项目:国家公益性行业农业科研专项项目,福建省自然科学基金,福建省科技重大专项,福建省教育厅项目,厦门市科技局项目
摘    要:对从福建省不同鳗鲡养殖场发病鳗鲡肝脏中分离并经感染证实的35株致病菌的16S rRNA基因进行序列测定和系统进化分析。用CTAB法提取各菌株DNA,以细菌16S rDNA通用引物进行PCR扩增,用限制性片段长度多态性分析1、6S rDNA序列分析和系统进化分析对其进行分子鉴定,构建系统进化树。结果表明:35株致病菌分别属于γ-变形菌纲和厚壁菌门2大类群的6个属和1个科,主要种类是气单胞菌属的嗜水气单胞菌、维氏气单胞菌、简氏气单胞菌和豚鼠气单胞菌等,占63%;其次是芽孢杆菌属细菌;少量为鲁氏耶尔森菌、弗氏柠檬酸杆菌、克雷伯氏菌属、假交替单胞菌属细菌和肠杆菌科细菌。

关 键 词:鳗鲡  病原菌  16S  rRNA基因  限制性片段长度多态性(RFLP)  系统进化树
收稿时间:3/5/2010 12:00:00 AM
修稿时间:2010/8/31 0:00:00

Sequencing and Phylogenetic Analysis of 16S rRNA Genes of Pathogenic Bacteria Isolated from Cultivated Eels
MA Ying,GUAN Rui-zhang,GUO Song-lin,DENG De-bo,ZHANG Jun-rong.Sequencing and Phylogenetic Analysis of 16S rRNA Genes of Pathogenic Bacteria Isolated from Cultivated Eels[J].Journal of Huazhong Agricultural University,2010,29(6):758-763.
Authors:MA Ying  GUAN Rui-zhang  GUO Song-lin  DENG De-bo  ZHANG Jun-rong
Abstract:
Keywords:cultivated eel  pathogenic bacteria  16S rRNA gene  restriction fragment length polymorphism (RFLP)  phylogenetic tree
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