| 水稻LEA_2家族的鉴定与表达谱分析 |
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| 引用本文： | 薛亚莉,魏晓双,周海连,李朝阳,胡利华,王令强,张翠翠.水稻LEA_2家族的鉴定与表达谱分析[J].华中农业大学学报,2021,40(2):93-102. |
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| 作者姓名： | 薛亚莉 魏晓双 周海连 李朝阳 胡利华 王令强 张翠翠 |
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| 基金项目： | 广西自然科学基金项目（2018GXNSFAA281116）； 国家重点研发计划项目（2018YFD0301303）; 国家自然科学基金项目（31771775； 31171524） |
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| 摘 要： | 为探索水稻LEA_2家族成员的特点,通过生物信息学分析从水稻基因组中鉴定出60个LEA_2家族成员,它们不均匀分布于12条染色体。蛋白序列分析结果显示,LEA_2家族蛋白的分子质量为16.24～49.14 ku,等电点4.7～11.7,有42个蛋白倾向于疏水;系统进化树分析显示,LEA_2家族可以分成5个组,同一组的蛋白成员包含的保守基序类型基本相同;基因结构分析表明LEA_2基因包含少量的内含子或者不含内含子;启动子分析表明水稻LEA_2基因启动子包含大量与逆境胁迫响应、激素信号传导及生长发育有关的作用元件。根据表达谱分层聚类分析及荧光定量PCR实验发现水稻LEA_2家族基因间共表达现象明显,同时发现OsLEA2-2和OsLEA2-26基因均受干旱胁迫上调表达60倍以上。
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| 关 键 词： | 水稻 LEA_2 非生物逆境胁迫 生物信息学 干旱胁迫 冷胁迫 淹水胁迫 盐胁迫 渗透胁迫 |
| 收稿时间： | 2020/11/9 0:00:00 |
Characterization and expression profile analysis of LEA_2 family in rice |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | rice LEA_2 abiotic stress bioinformatics drought stress cold stress flooding stress salt stress osmotic stress |
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