金鱼头瘤形成相关基因差减文库的构建与分析 |
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引用本文: | 张运超,何川,顾泽茂.金鱼头瘤形成相关基因差减文库的构建与分析[J].华中农业大学学报,2014,33(1):85-91. |
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作者姓名: | 张运超 何川 顾泽茂 |
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作者单位: | 北京市水产技术推广站,北京100021;华中农业大学水产学院,武汉430070;北京市水产技术推广站,北京100021;华中农业大学水产学院,武汉430070;华中农业大学水产学院,武汉430070;淡水水产健康养殖湖北省协同创新中心,武汉 430070 |
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基金项目: | 现代农业产业技术体系北京市观赏鱼创新项目(pxm2012-036237-000139) |
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摘 要: | 采用差减抑制杂交技术(SSH)以1龄红狮头金鱼(Carassius auratus)的头瘤组织为检测子(Tester),40日龄红狮头金鱼幼鱼的头顶上皮组织为驱动子(Driver),构建金鱼头瘤相关基因的差减cDNA文库。以鲫管家基因α-tubilin为参照检测差减效率,结果表明该文库差减效率达210倍,效率较高。随机挑选阳性克隆进行接头特异引物的PCR检测,结果表明插入片段均在0.1~2.0kb之间。利用斑点杂交对PCR检测结果为单一条带的阳性克隆进行筛选并测序,获得高差异性的有效序列93条。通过生物信息学方法对文库序列进行比对、分类和注释,发现若干结缔形成基因和原癌/抑癌基因等与金鱼头瘤形成相关的功能基因,表明cDNA文库构建成功。
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关 键 词: | 金鱼 头瘤 差减抑制杂交 cDNA文库 |
收稿时间: | 5/9/2013 12:00:00 AM |
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