团头鲂SREBP1基因的克隆及其表达分析 |
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引用本文: | 吴文新,曹赞,王凡,徐佳,王卫民,赵玉华.团头鲂SREBP1基因的克隆及其表达分析[J].华中农业大学学报,2019,38(2):9-16. |
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作者姓名: | 吴文新 曹赞 王凡 徐佳 王卫民 赵玉华 |
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作者单位: | 华中农业大学水产学院/农业农村部淡水生物繁育重点实验室/农业动物遗传育种与繁育教育部重点实验室/池塘健康养殖湖北省工程实验室,武汉,430070;华中农业大学水产学院/农业农村部淡水生物繁育重点实验室/农业动物遗传育种与繁育教育部重点实验室/池塘健康养殖湖北省工程实验室,武汉,430070;华中农业大学水产学院/农业农村部淡水生物繁育重点实验室/农业动物遗传育种与繁育教育部重点实验室/池塘健康养殖湖北省工程实验室,武汉,430070;华中农业大学水产学院/农业农村部淡水生物繁育重点实验室/农业动物遗传育种与繁育教育部重点实验室/池塘健康养殖湖北省工程实验室,武汉,430070;华中农业大学水产学院/农业农村部淡水生物繁育重点实验室/农业动物遗传育种与繁育教育部重点实验室/池塘健康养殖湖北省工程实验室,武汉,430070;华中农业大学水产学院/农业农村部淡水生物繁育重点实验室/农业动物遗传育种与繁育教育部重点实验室/池塘健康养殖湖北省工程实验室,武汉,430070 |
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基金项目: | 国家自然科学基金项目(31401976) |
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摘 要: | 为阐明团头鲂SREBP-1的功能,采用RT-PCR技术克隆获得SREBP-1基因的cDNA序列,利用荧光定量PCR(qRT-PCR)检测SREBP-1基因在不同发育时期及不同组织中的表达情况。生物信息学分析发现,SREBP-1基因cDNA的编码序列(coding sequence,CDS)为3 426bp(GenBank登录号:MH633449),开放阅读框(ORF)编码1 141个氨基酸,与大西洋鲑、斑马鱼、草鱼、鲤、金线鲃SREBP-1的氨基酸序列相似性较高(74%~99%)。保守结构域分析显示,团头鲂SREBP-1蛋白具有SREBPs家族典型的"碱性螺旋-环-螺旋-亮氨酸拉链"(bHLH-Zip)结构域。表达分析结果显示,SREBP-1基因在团头鲂胚胎发育过程中的表达呈现先下降后增高的趋势,在眼囊期最低,至出膜期达到最高。在团头鲂幼鱼中,SREBP-1在脑组织中的表达量最高,其次是眼、肝脏、心脏、肌肉、脂肪组织、肾脏,鳃中表达量最低。在成鱼中,SREBP-1在脑组织表达量最高,其次是性腺组织、肌肉、肝脏、眼,肾脏、脾脏和心脏中的表达量较低。以上结果表明,SREBP-1基因在团头鲂幼鱼和成鱼的不同组织中的表达模式存在差异。
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关 键 词: | 团头鲂 固醇调节元件结合蛋白-1 克隆 表达 |
收稿时间: | 2018/7/20 0:00:00 |
Cloning and expression of SREBP1 gene in Megalobrama amblycephala |
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Abstract: | |
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Keywords: | |
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