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环介导等温扩增法(LAMP)检测最短尾短体线虫
引用本文:刘星彤,林柏荣,廖金铃,卓侃.环介导等温扩增法(LAMP)检测最短尾短体线虫[J].华中农业大学学报,2018,37(6):17-24.
作者姓名:刘星彤  林柏荣  廖金铃  卓侃
作者单位:华南农业大学农学院,广州 510642; 洛阳科技职业学院,洛阳 471822,华南农业大学农学院,广州 510642;.广东省微生物信号与作物病害防控重点实验室,广州510642,华南农业大学农学院,广州 510642;.广东省微生物信号与作物病害防控重点实验室,广州510642,华南农业大学农学院,广州 510642;.广东省微生物信号与作物病害防控重点实验室,广州510642
基金项目:国家自然科学基金项目(31471750);广东省林业科技创新专项(2015KJCX045)
摘    要:为了快速、简便、准确地检测重要植物病原线虫—最短尾短体线虫( Pratylenchus brachyurus ),依据GenBank中短体线虫的线粒体DNA细胞色素氧化酶I(mtDNA COI)序列,设计了扩增最短尾短体线虫的环介导等温扩增(loop-mediated isothermal amplification,LAMP)引物,并对LAMP反应条件进行优化,成功建立了一种可特异、快速检测最短尾短体线虫的LAMP体系。该体系在64℃下反应60 min,扩增效率最高。用琼脂糖凝胶电泳、酶切分析和SYBR Green I染色均能特异检测到最短尾短体线虫的扩增产物。所建立的LAMP体系能从供试的9种短体线虫和另外10种植物线虫中特异检测出最短尾短体线虫,其灵敏度可检测到1/200条线虫DNA,是常规PCR的10倍。表明本研究建立的最短尾短体线虫的LAMP检测体系,可用于最短尾短体线虫的快速检测。

关 键 词:最短尾短体线虫    环介导等温扩增    线粒体DNA细胞色素氧化酶I    快速检测

Detection of Pratylenchus brachyurus by loop-mediated isothermal amplification
Abstract:
Keywords:Pratylenchus brachyurus  loop-mediated isothermal amplification (LAMP)  mtDNA  COI  rapid detection
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