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虹彩病毒蛙病毒属病毒实时荧光PCR检测方法的建立
引用本文:李惠芳,吕建强,岳志芹,刘荭,田飞焱,何俊强,蔡依娜,陈昌福.虹彩病毒蛙病毒属病毒实时荧光PCR检测方法的建立[J].华中农业大学学报,2008,27(2):172-176.
作者姓名:李惠芳  吕建强  岳志芹  刘荭  田飞焱  何俊强  蔡依娜  陈昌福
作者单位:1. 华中农业大学水产学院,武汉,430070
2. 深圳出入境检验检疫局,深圳,518001
3. 山东出入境检验检疫局,青岛,266002
基金项目:国家高技术研究发展计划(863计划) , 国家质量监督检验检疫总局科研项目 , 深圳出入境检验检疫局科研课题
摘    要:在GenBank 中搜寻虹彩病毒蛙病毒属主衣壳蛋白(MCP)基因序列并进行多重比较后,利用其中的保守序列,设计引物和Taqman探针,建立了虹彩病毒蛙病毒属实时荧光PCR检测方法.对荧光PCR反应条件进行优化,评估该检测方法的特异性、稳定性和重复性,利用10倍系列稀释法检验其灵敏度并与常规PCR做了比较.结果显示,该方法对虹彩病毒蛙病毒属成员(新加坡石斑鱼虹彩病毒除外)的检测有高度的特异性,与淋巴囊肿病毒、鳜鱼传染性脾肾坏死病毒、真鲷虹彩病毒、锦鲤疱疹病毒等其他水生动物病毒之间均无交叉反应,有良好的特异性,检测总DNA灵敏度为4.5×10-3pg/μL,比传统PCR的敏感度高出100倍,可对低病毒含量的样品进行准确检测.制作的标准曲线有极好的线性关系,且线性范围宽,相关系数为0.998 4.组内和组间重复试验的Ct值标准偏差分别为1.2%和1.6%,有良好的重复性.与常规的PCR相比较,该方法具有快速、特异、敏感、可定量、可同时检测大量样品等优点,可用于出入境检疫和动物防疫监督部门对虹彩病毒蛙病毒属的疫情监测.

关 键 词:虹彩病毒蛙病毒属  实时荧光定量PCR  检测

Development of Real-time PCR Assay Detecting Ranavirus,Family Iridoviridae
LI Hui-fang,LV Jian-qiang,YUE Zhi-qin,LIU Hong,TIAN Fei-yan,HE Jun-qiang,CAI Yi-n,CHEN Chang-fu.Development of Real-time PCR Assay Detecting Ranavirus,Family Iridoviridae[J].Journal of Huazhong Agricultural University,2008,27(2):172-176.
Authors:LI Hui-fang  LV Jian-qiang  YUE Zhi-qin  LIU Hong  TIAN Fei-yan  HE Jun-qiang  CAI Yi-n  CHEN Chang-fu
Abstract:In order to establish a real-time PCR method for rapid detection of Ranavirus(family Iridoviridae),the MCP gene of Ranavirus were down-loaded from GenBank.The gene sequences of MCP were aligned by using the biologic software and the specific primers and probe were designed in the conserved region.The primers,probe and the reactive condition were optimized to improve the sensitivity.The specificity,sensitivity,reproducibility of the method were estimated to establish a relatively quantitative standard curve....
Keywords:Ranavirus  real-time fluorescent quantitative PCR  detection  
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