| 玛瑙红樱桃病毒病小RNA的高通量测序检测 |
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| 引用本文： | 洪怡,文壮,田田,文晓鹏.玛瑙红樱桃病毒病小RNA的高通量测序检测[J].贵州农业科学,2020,48(6):63-66. |
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| 作者姓名： | 洪怡 文壮 田田 文晓鹏 |
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| 作者单位： | 贵州大学农业生物工程研究院/生命科学学院,山地植物资源保护与种质创新教育部重点实验室,贵州贵阳550025,贵州大学农业生物工程研究院/生命科学学院,山地植物资源保护与种质创新教育部重点实验室,贵州贵阳550025,贵州大学农业生物工程研究院/生命科学学院,山地植物资源保护与种质创新教育部重点实验室,贵州贵阳550025,贵州大学农业生物工程研究院/生命科学学院,山地植物资源保护与种质创新教育部重点实验室,贵州贵阳550025 |
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| 基金项目： | 贵州省科技厅-贵州大学科技合作计划项目“利用高通量测序技术分析鉴定贵州樱桃病毒病”［黔科合LH 字( 2016) 7451］ |
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| 摘 要： | 为玛瑙红樱桃病毒病的防治与控制提供参考，采用第2代测序技术对玛瑙红樱桃黄化叶片进行小RNA测序，利用Velet软件对获得的小RNA进行组装，再将得到的重叠群（contigs）与数据库比对寻找其中的病毒序列。结果表明：贵州省玛瑙红樱桃纳雍县样本中的候选病毒库中，樱桃小果病毒 2 比对到的 reads 有 6 014 条，占总参考序列 mapped reads 的75.62%，其樱桃产区存在樱桃小果病毒2；在福泉、六枝产区未检出。贵州省玛瑙红樱桃部分产区存在病毒病，病原较单一，部分产区樱桃黄化症状不是由病毒病引起。
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| 关 键 词： | 玛瑙红樱桃 高通量测序 病毒检测 |
Small RNA of Viral Disease in Manaohong Cherry by High-throughput Sequencing |
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| HONG Yi,WEN Zhuang,TIAN Tian,WEN Xiaopeng.Small RNA of Viral Disease in Manaohong Cherry by High-throughput Sequencing[J].Guizhou Agricultural Sciences,2020,48(6):63-66. |
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| Authors: | HONG Yi WEN Zhuang TIAN Tian WEN Xiaopeng |
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