家蚕质型多角体病毒苏州株基因组片段2的克隆与分析 |
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引用本文: | 刘卫星,孟祥坤,薛仁宇,曹广力,贡成良.家蚕质型多角体病毒苏州株基因组片段2的克隆与分析[J].江苏农业科学,2011(1). |
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作者姓名: | 刘卫星 孟祥坤 薛仁宇 曹广力 贡成良 |
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作者单位: | 苏州大学医学部,江苏苏州,215123 |
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基金项目: | 国家自然科学基金,苏州大学重大应用研究培育项目 |
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摘 要: | 为了探讨呼肠孤病毒科依赖RNA的RNA聚合酶(RNA-dependent RNA polymerase,RDRP)基因的遗传与变异,通过RT-PCR对家蚕质型多角体病毒(Bombyx mori cytoplasmic polyhedrosis virus)苏州株(BmCPV-suzhou)的S2片段进行了分段克隆,对各克隆的测序结果进行拼接,获得了S2片段的全长序列.分析显示,BmCPV-suzhou S2片段的全长为3 854 bp(GenBank登录号:CQ924586),含有1个3 678 bp的编码RDRP基因的开放阅读框,并分别在5′和3′端发现了保守序列AGUAA和GUUAGCC.RDRP的氨基酸序列比对分析结果显示,BmCPV-suzhou与BmCPV-china、BmCPV-1、舞毒蛾(Lymantria dispar)CPV-1(LdCPV-1)、马尾松毛虫(Dendrolimus punctatus)CPV-1(DpCPV-1)、舞毒蛾CPV-14(LdCPV-14)、棉铃虫(Heliothis armigera)CPV-14(HaCPV-14)的相似性分别为99%、97%、94%、94%、54%、55%.基于RDRP氨基酸序列的系统进化分析表明,BmCPV的不同株系与LdCPV-1、DpCPV-1聚为一类.
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关 键 词: | 家蚕质型多角体病毒 S2片段 序列分析 |
Cloning and sequence analysis of segment 2 of the Bombyx mori cytoplasmic polyhedrosis virus suzhou strain |
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Abstract: | |
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Keywords: | RDRP |
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