| 截形苜蓿吡哆醇生物合成基因的电子克隆和进化分析 |
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| 引用本文： | 李蕊,孟宪萍,胡英考,蔡民华,李雅轩.截形苜蓿吡哆醇生物合成基因的电子克隆和进化分析[J].江苏农业科学,2007(1):81-84. |
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| 作者姓名： | 李蕊 孟宪萍 胡英考 蔡民华 李雅轩 |
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| 作者单位： | 首都师范大学生命科学学院,北京,100037 |
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| 基金项目： | 北京市教委科技发展计划项目 |
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| 摘 要： | 电子克隆是随着基因组计划和EST计划实施而发展起来的、利用生物信息学手段进行基因克隆的新方法。根据物种间同源基因相对保守的特点,利用生物信息学的方法,以拟南芥吡哆醇生物合成蛋白基因(PDX)cDNA序列为探针,在GenBank的HTGs数据库中找到与之高度同源的截形苜蓿的基因组序列———m th2-17p16克隆,通过GenScan软件预测和序列拼接得到了截形苜蓿吡哆醇生物合成基因序列(GenBank登录号为DQ139263)。用该序列对GenBank中的est-others进行相似性搜索,获得了25条截形苜蓿的EST序列,经拼接后发现与基因组预测的基因序列一致,表明该基因是真实存在和表达的。该cDNA序列长度为1 257 bp,具有完整的开放式阅读框(ORF 29-973bp),推测编码314个氨基酸。通过对日本百脉根(Lotus corniculatusvar.japoni-cus)、烟草(Nicotiana tabacum)、拟南芥(Arabidopsis thaliana)、大豆(Glycine max)、小麦(Triticum aestivum)和水稻(O ryza sativa)等进行吡哆醇生物合成蛋白序列同源比较,发现该基因具有高度的保守性。
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| 关 键 词： | 电子克隆 截形苜蓿 吡哆醇 生物合成基因 EST |
| 文章编号： | 1002-1302(2007)01-0081-04 |
| 修稿时间： | 2006-07-24 |
In silico cloning of biosynthesis gene of pyridoxine from Medicago truncatula and its evolution analysis |
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| Li Rui.In silico cloning of biosynthesis gene of pyridoxine from Medicago truncatula and its evolution analysis[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2007(1):81-84. |
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| Authors: | Li Rui |
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| Keywords: | |
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