正交设计优化广藿香基因组SRAP扩增体系的研究 |
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引用本文: | 吴友根,郭巧生,何际婵,林尤奋.正交设计优化广藿香基因组SRAP扩增体系的研究[J].江苏农业科学,2010(4). |
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作者姓名: | 吴友根 郭巧生 何际婵 林尤奋 |
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作者单位: | 1. 南京农业大学中药材研究所,江苏南京,210095;中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所,海南儋州,571737 2. 南京农业大学中药材研究所,江苏南京,210095 3. 中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所,海南儋州,571737 4. 热带园艺植物资源与遗传改良教育部重点实验室/海南大学园艺园林学院,海南海口,570228 |
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基金项目: | 国家自然科学基金,中央级公益性科研院所基本科研业务费专项资金,海南省自然科学基金,海南省教育厅高等学校科学研究项目,海南大学科研项目,海南大学科研启动基金 |
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摘 要: | 以改良CTAB法提取的广藿香叶片DNA为模板,采用正交试验设计,从Mg2+、dNTP、引物浓度和DNA聚合酶4因素3水平,对SRAP扩增效果进行研究,比较不同模板DNA浓度对PCR扩增的影响,确立适合广藿香SRAP-PCR反应的最佳体系.利用SRAP-PCR优化体系对引物进行了全面筛选.结果表明:各因素不同水平浓度对PCR反应结果均有显著影响,总体积20μL的SRAP-PCR优化反应体系中含有:2 μL 10×buffer、20 ng模板DNA、1.5 mmol/L Mg2+、250 μmol/L dNTP、0.3 μmol/L Primer、Taq DNA聚合酶1.5 U.运用该体系对部分广藿香单株进行检验,证明该体系稳定可靠;以此体系为基础从90对引物中共筛选出扩增条带清晰、多态性丰富的SRAP引物18对.
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关 键 词: | 广藿香 SRAP标记 正交试验 体系优化 |
Optimization of SRAP-PCR system on Pogostemon cablin by orthongonal design |
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Abstract: | |
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Keywords: | |
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