基于高通量测序技术鉴定栽培草莓资源携带的病毒种类 |
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引用本文: | 刘思佳,曾祥国,肖桂林,王涌,韩永超.基于高通量测序技术鉴定栽培草莓资源携带的病毒种类[J].江苏农业科学,2023(19):18-23. |
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作者姓名: | 刘思佳 曾祥国 肖桂林 王涌 韩永超 |
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作者单位: | 1. 湖北省农业科学院经济作物研究所;2. 华中农业大学园艺林学学院 |
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摘 要: | 分析草莓种质资源的病毒携带情况,为草莓脱毒种苗的繁育和病毒病的防治提供依据。针对保存的86份栽培草莓材料,分别提取每份材料的叶片总RNA,将待测草莓总RNA混样,然后采用高通量测序技术进行测序。根据每种病毒的序列保守区设计引物,采用RT-PCR对高通量测序的结果进行验证。利用设计的引物分别对每份草莓品种材料进行RT-PCR检测,明确每份材料的带毒情况。测序结果表明,从86份草莓资源中检测出3种病毒,分别为草莓斑驳病毒(strawberry mottle virus,简称SMoV)、草莓镶脉病毒(strawberry vein banding virus,简称SVBV)和草莓白化病毒(strawberry pallidosis-associated virus,简称SPaV),该结果与RT-PCR验证的结果相符。在所有86份供试样品中,28份材料带有病毒,病毒感染率为32.56%;其中,23份材料带有SVBV;11份材料带有SMoV;5份材料带有SPaV。单一病毒侵染样品18份,复合侵染材料共10份,草莓种苗带毒率高,草莓病毒病危害严重。
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关 键 词: | 草莓 病毒病 高通量测序 RT-PCR 草莓白化病毒 |
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