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枳漆酶基因家族鉴定及其响应盐胁迫的表达分析
引用本文:徐小勇,顾铭洲,梁梦鸽,姜丽娟.枳漆酶基因家族鉴定及其响应盐胁迫的表达分析[J].江苏农业科学,2023(9):52-59.
作者姓名:徐小勇  顾铭洲  梁梦鸽  姜丽娟
作者单位:扬州大学园艺园林学院
基金项目:国家重点研发计划(编号:2018YFD1000107);;江苏省农业科技自主创新资金[编号:CX(21)3024];
摘    要:漆酶(LAC)是植物木质素生物合成中催化木质素单体聚合的关键酶,在调控植物生长发育和胁迫响应中发挥着重要作用。对枳漆酶基因家族进行鉴定和分析,并探究其在盐胁迫下的表达模式,可为进一步研究枳漆酶基因功能提供重要的参考信息。采用生物信息学手段鉴定枳漆酶基因家族成员,对其家族成员的理化性质、基因结构、系统进化关系、启动子顺式作用元件等进行分析,并通过qRT-PCR方法分析其盐胁迫表达模式。结果表明,枳基因组中共有20个LAC基因家族成员,其中18个分布在5条已知染色体上,2个分布在未知染色体上,被预测定位到细胞膜和细胞核中;共有6~14个外显子,5~13个内含子,9~11个motif;系统进化树分析结果显示,20个枳LAC基因家族成员与17个拟南芥LAC基因家族成员共分成7个亚组,20个枳LAC基因家族成员分布在其中的6组;20个枳LAC基因家族成员与拟南芥LAC基因间存在19对共线性关系;启动子区域含有24种顺式作用元件,其中厌氧诱导元件、干旱响应元件和茉莉酸甲酯响应元件数量最多;16个枳LAC基因在盐胁迫下显著上调表达,推测枳漆酶基因参与了盐胁迫响应。

关 键 词:  漆酶基因  进化树  顺式作用元件  盐胁迫
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