正交设计优化番茄基因组DNA SSR-PCR反应体系 |
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引用本文: | 王欢欢,姜晶,王慧,孙周平.正交设计优化番茄基因组DNA SSR-PCR反应体系[J].江苏农业科学,2009(2). |
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作者姓名: | 王欢欢 姜晶 王慧 孙周平 |
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作者单位: | 沈阳农业大学园艺学院,辽宁沈阳,110161 |
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基金项目: | 辽宁省教育厅项目(编号:05L412) |
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摘 要: | 以21份番茄品种为材料,应用正交试验设计对影响番茄SSR—PCR的主要参数进行优化,建立适于番茄的SSR反应体系和扩增程序。在15μl体系中各反应的最适合含量为:2.5μl ddH2O,1μl 40ng模板DNA,3μl 200μmol/L dNTP,3μl 0.8μmol/L SSR引物,0.1μl 0.5U/μl Taq DNA聚合酶,1.5μl 10×PCR Buffer,0.9μl 1.5mmol/L MgCl2。PCR适宜扩增程序为:94℃预变性2min;94℃变性1min,45℃退火25s,共35个循环;68℃延伸25s,68℃延伸10min,然后4℃保存。利用此反应体系对21个番茄品种进行PCR扩增并电泳检测,扩增结果清晰且有较高的多态性,表明该体系适合番茄的遗传多样性研究。
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关 键 词: | 番茄 SSR 体系研究 优化 |
Optlimization of ISSR-PCR reaction system in tomato genomic DNA by orthogonal design |
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Abstract: | |
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