地衣芽孢杆菌几丁质酶的生物信息学分析

目的应用生物信息学的方法预测地衣芽孢杆菌几丁质酶的结构与功能。方法登陆NCBI数据库搜索目标酶的氨基酸序列,用生物信息学软件ProtParam、SIGNALIP、SWISS-MODEL等预测该酶的理化性质、信号肽及跨膜区、空间结构等。结果该酶是由693个氨基酸组成的蛋白质,相对分子质量为77803.79,分子式为C_(3483)H~(5251)N~(937)O~(1059)S~(19),理论等电点为5.42,不稳定系数为33.82,亲水性系数为-0.590,二级结构中α-螺旋、β-折叠、无规则卷曲所占比分别为15.73%、26.55%和57.72%。结论地衣芽孢杆菌几丁质酶为一种亲水性蛋白,有磷酸化、乙酰化位点,有信号肽,可分泌,可能作为一种胞外因子与其他物质共同作用,为其进一步研究提供新方向。