| 番木瓜环斑病毒海南分离物全基因组结构分析 |
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| 引用本文： | 卢雅薇,沈文涛,唐清杰,牛艳梅,周鹏.番木瓜环斑病毒海南分离物全基因组结构分析[J].广东农业科学,2007(9):54-58. |
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| 作者姓名： | 卢雅薇 沈文涛 唐清杰 牛艳梅 周鹏 |
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| 作者单位： | 中国热带农科院热带生物技术研究所/热带作物生物技术国家重点实验室,海南,海口,571101 |
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| 摘 要： | 从感病的海南番木瓜叶片中提取总RNA,经RT-PCR和RACE方法分段扩增番木瓜环斑病毒(PRSV)全基因组序列.序列拼接结果显示,PRSV中国海南分离株(HaiNan-P)基因组除3'-末端polyA尾巴外,由10323个核苷酸组成,编码3343个氨基酸.同源性分析表明,HaiNan-P编码的氨基酸序列与GenBank中公布的11株PRSV同源性为89.8%～93.2%,略高于全长核苷酸的82.3%～89.1%.P1蛋白编码区同源性较低,仅为65.4%～80.1%,而HC-Pro、CI及CP同源性相对较高.运用MEGA 3.1软件、NJ法绘制系统进化树,分析结果显示,PRSV分离株类群分化与地理分布有一定的相关性.
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| 关 键 词： | 番木瓜环斑病毒 全基因组 同源性 系统进化树 |
| 文章编号： | 1004-874X（2007）09-0054-05 |
| 修稿时间： | 2007-06-15 |
Structure analysis of the complete genome of papaya ringspot virus Hainan isolate |
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| LU Ya-wei,SHEN Wen-tao,TANG Qing-jie,NIU Yan-mei,ZHOU Peng.Structure analysis of the complete genome of papaya ringspot virus Hainan isolate[J].Guangdong Agricultural Sciences,2007(9):54-58. |
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| Authors: | LU Ya-wei SHEN Wen-tao TANG Qing-jie NIU Yan-mei ZHOU Peng |
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| Institution: | State Key Biotechnology Laboratory for Tropical Crops / Institute of BioScience and Biotechnology, CA TAS, Haikou 571101, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Papaya ringspot virus genome homology phylogenetic tree |
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