| 香蕉枯萎病菌SNF1基因的克隆及生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 刘一贤,周端咏,毛超,汪军,黄俊生.香蕉枯萎病菌SNF1基因的克隆及生物信息学分析[J].广东农业科学,2012,39(21):160-164. |
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| 作者姓名： | 刘一贤 周端咏 毛超 汪军 黄俊生 |
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| 作者单位： | 1. 海南大学环境与植物保护学院,海南海口570100;中国热带农业科学院环境与植物保护研究所/农业部热带农林有害生物入侵监测与控制重点开放实验室,海南儋州571737
2. 海南大学环境与植物保护学院,海南海口,570100 |
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| 基金项目： | 国家公益性行业(农业)科研专项，中央级公益性科研院所基本科研业务费专项 |
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| 摘 要： | 为了解SNF1基因在香蕉枯萎病菌致病过程中的作用以及FOC1和FOC4两个生理小种之间的致病力差异关系,采用了PCR、RT-PCR的方法扩增了2个生理小种的SNF1基因,测序并采用生物信息学软件对相似序列进行搜索、比对,并对该基因编码的预测蛋白进行氨基酸序列比对和分析。研究结果显示,2个生理小种的SNF1基因的ORF分别为2 136、2 130 bp,二者相差6个碱基,同源性为99.5%。FOC1和FOC4的SNF1基因分别编码711、709个氨基酸,相差两个氨基酸,为丝氨酸(FOC1)和谷氨酰胺(FOC1)。生物信息学软件预测结果表明该蛋白N端不存在信号肽,但具有两个相同的功能结构域位点,分子量约为79 ku,pI为6.80。
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| 关 键 词： | 香蕉枯萎病菌 生理小种 SNF1基因 细胞壁降解酶 致病性 |
Cloning and bioinformatics analysis of SNF1 gene from Fusarium oxysporum f.sp.cubense |
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| LIU Yi-xian
,
ZHOU Duan-yong
,
MAO Chao
,
WANG Jun
,
HUANG Jun-sheng.Cloning and bioinformatics analysis of SNF1 gene from Fusarium oxysporum f.sp.cubense[J].Guangdong Agricultural Sciences,2012,39(21):160-164. |
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| Authors: | LIU Yi-xian ZHOU Duan-yong MAO Chao WANG Jun HUANG Jun-sheng |
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| Institution: | 1.Environment and Plant Protection Academy,Hainan University,Haikou 570100,China; 2.Key Laboratory of Monitoring and Control of Tropical Agricultural and Forest Invasive Alien Pests,Ministry of Agriculture/ Environment and Plant Protection Institute,Chinese Academy of Tropical Agricultural Sciences,Danzhou 571737,China) |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | |
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